Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stx12Q9ER00 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stx12Q9ER00 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stx12Q9ER00 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stx12Q9ER00 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stx12Q9ER00 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stx12Q9ER00 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx12Q9ER00 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Stx12Q9ER00 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Stx12Q9ER00 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx12Q9ER00 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx12Q9ER00 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx12Q9ER00 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx12Q9ER00 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Stx12Q9ER00 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Stx12Q9ER00 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx12Q9ER00 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx12Q9ER00 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx12Q9ER00 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx12Q9ER00 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Stx12Q9ER00 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx12Q9ER00 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Stx12Q9ER00 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Stx12Q9ER00 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx12Q9ER00 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx12Q9ER00 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx12Q9ER00 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx12Q9ER00 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx12Q9ER00 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx12Q9ER00 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx12Q9ER00 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx12Q9ER00 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx12Q9ER00 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx12Q9ER00 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx12Q9ER00 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx12Q9ER00 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx12Q9ER00 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx12Q9ER00 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx12Q9ER00 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx12Q9ER00 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx12Q9ER00 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx12Q9ER00 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx12Q9ER00 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx12Q9ER00 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx12Q9ER00 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx12Q9ER00 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx12Q9ER00 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx12Q9ER00 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx12Q9ER00 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx12Q9ER00 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx12Q9ER00 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx12Q9ER00 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx12Q9ER00 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx12Q9ER00 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx12Q9ER00 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx12Q9ER00 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx12Q9ER00 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx12Q9ER00 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx12Q9ER00 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx12Q9ER00 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx12Q9ER00 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx12Q9ER00 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx12Q9ER00 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx12Q9ER00 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx12Q9ER00 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx12Q9ER00 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx12Q9ER00 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx12Q9ER00 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx12Q9ER00 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx12Q9ER00 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx12Q9ER00 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx12Q9ER00 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx12Q9ER00 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx12Q9ER00 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx12Q9ER00 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx12Q9ER00 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx12Q9ER00 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx12Q9ER00 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx12Q9ER00 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx12Q9ER00 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx12Q9ER00 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx12Q9ER00 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx12Q9ER00 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx12Q9ER00 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx12Q9ER00 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx12Q9ER00 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx12Q9ER00 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx12Q9ER00 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx12Q9ER00 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx12Q9ER00 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Stx12Q9ER00 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx12Q9ER00 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx12Q9ER00 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx12Q9ER00 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx12Q9ER00 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx12Q9ER00 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx12Q9ER00 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx12Q9ER00 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx12Q9ER00 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx12Q9ER00 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms