Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM6

Dgcr8, Microprocessor complex subunit DGCR8, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr8Q9EQM6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dgcr8Q9EQM6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Dgcr8Q9EQM6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dgcr8Q9EQM6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dgcr8Q9EQM6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Dgcr8Q9EQM6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dgcr8Q9EQM6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dgcr8Q9EQM6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dgcr8Q9EQM6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dgcr8Q9EQM6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dgcr8Q9EQM6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dgcr8Q9EQM6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dgcr8Q9EQM6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dgcr8Q9EQM6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dgcr8Q9EQM6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dgcr8Q9EQM6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dgcr8Q9EQM6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dgcr8Q9EQM6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dgcr8Q9EQM6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dgcr8Q9EQM6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Dgcr8Q9EQM6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dgcr8Q9EQM6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dgcr8Q9EQM6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dgcr8Q9EQM6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dgcr8Q9EQM6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dgcr8Q9EQM6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dgcr8Q9EQM6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dgcr8Q9EQM6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dgcr8Q9EQM6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dgcr8Q9EQM6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Dgcr8Q9EQM6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dgcr8Q9EQM6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dgcr8Q9EQM6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dgcr8Q9EQM6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dgcr8Q9EQM6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dgcr8Q9EQM6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dgcr8Q9EQM6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dgcr8Q9EQM6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dgcr8Q9EQM6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dgcr8Q9EQM6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dgcr8Q9EQM6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Dgcr8Q9EQM6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Dgcr8Q9EQM6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dgcr8Q9EQM6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dgcr8Q9EQM6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dgcr8Q9EQM6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dgcr8Q9EQM6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dgcr8Q9EQM6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dgcr8Q9EQM6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dgcr8Q9EQM6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Dgcr8Q9EQM6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dgcr8Q9EQM6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dgcr8Q9EQM6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dgcr8Q9EQM6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dgcr8Q9EQM6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dgcr8Q9EQM6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dgcr8Q9EQM6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dgcr8Q9EQM6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dgcr8Q9EQM6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dgcr8Q9EQM6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dgcr8Q9EQM6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dgcr8Q9EQM6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dgcr8Q9EQM6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Dgcr8Q9EQM6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dgcr8Q9EQM6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dgcr8Q9EQM6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dgcr8Q9EQM6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dgcr8Q9EQM6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dgcr8Q9EQM6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dgcr8Q9EQM6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dgcr8Q9EQM6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dgcr8Q9EQM6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dgcr8Q9EQM6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dgcr8Q9EQM6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dgcr8Q9EQM6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dgcr8Q9EQM6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dgcr8Q9EQM6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dgcr8Q9EQM6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dgcr8Q9EQM6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dgcr8Q9EQM6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dgcr8Q9EQM6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dgcr8Q9EQM6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dgcr8Q9EQM6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Dgcr8Q9EQM6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dgcr8Q9EQM6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dgcr8Q9EQM6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dgcr8Q9EQM6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dgcr8Q9EQM6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dgcr8Q9EQM6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dgcr8Q9EQM6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Dgcr8Q9EQM6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Dgcr8Q9EQM6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dgcr8Q9EQM6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dgcr8Q9EQM6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dgcr8Q9EQM6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dgcr8Q9EQM6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dgcr8Q9EQM6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dgcr8Q9EQM6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dgcr8Q9EQM6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dgcr8Q9EQM6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms