Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ28

Pold3, DNA polymerase delta subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold3Q9EQ28 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pold3Q9EQ28 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pold3Q9EQ28 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pold3Q9EQ28 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pold3Q9EQ28 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pold3Q9EQ28 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pold3Q9EQ28 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pold3Q9EQ28 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pold3Q9EQ28 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pold3Q9EQ28 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pold3Q9EQ28 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pold3Q9EQ28 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Pold3Q9EQ28 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pold3Q9EQ28 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pold3Q9EQ28 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pold3Q9EQ28 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pold3Q9EQ28 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pold3Q9EQ28 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pold3Q9EQ28 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pold3Q9EQ28 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pold3Q9EQ28 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pold3Q9EQ28 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pold3Q9EQ28 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pold3Q9EQ28 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pold3Q9EQ28 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pold3Q9EQ28 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pold3Q9EQ28 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pold3Q9EQ28 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pold3Q9EQ28 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pold3Q9EQ28 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pold3Q9EQ28 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pold3Q9EQ28 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pold3Q9EQ28 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pold3Q9EQ28 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pold3Q9EQ28 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pold3Q9EQ28 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pold3Q9EQ28 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pold3Q9EQ28 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pold3Q9EQ28 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pold3Q9EQ28 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pold3Q9EQ28 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pold3Q9EQ28 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pold3Q9EQ28 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pold3Q9EQ28 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pold3Q9EQ28 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pold3Q9EQ28 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pold3Q9EQ28 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pold3Q9EQ28 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pold3Q9EQ28 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pold3Q9EQ28 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pold3Q9EQ28 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pold3Q9EQ28 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pold3Q9EQ28 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pold3Q9EQ28 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pold3Q9EQ28 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pold3Q9EQ28 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pold3Q9EQ28 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pold3Q9EQ28 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pold3Q9EQ28 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pold3Q9EQ28 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pold3Q9EQ28 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pold3Q9EQ28 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pold3Q9EQ28 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pold3Q9EQ28 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pold3Q9EQ28 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pold3Q9EQ28 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pold3Q9EQ28 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pold3Q9EQ28 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pold3Q9EQ28 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pold3Q9EQ28 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pold3Q9EQ28 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pold3Q9EQ28 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pold3Q9EQ28 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pold3Q9EQ28 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pold3Q9EQ28 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pold3Q9EQ28 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pold3Q9EQ28 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pold3Q9EQ28 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pold3Q9EQ28 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pold3Q9EQ28 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pold3Q9EQ28 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pold3Q9EQ28 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pold3Q9EQ28 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pold3Q9EQ28 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pold3Q9EQ28 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pold3Q9EQ28 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pold3Q9EQ28 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pold3Q9EQ28 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pold3Q9EQ28 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pold3Q9EQ28 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pold3Q9EQ28 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pold3Q9EQ28 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pold3Q9EQ28 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pold3Q9EQ28 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pold3Q9EQ28 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pold3Q9EQ28 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pold3Q9EQ28 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pold3Q9EQ28 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pold3Q9EQ28 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pold3Q9EQ28 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms