Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cmtr1Q9DBC3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cmtr1Q9DBC3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cmtr1Q9DBC3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cmtr1Q9DBC3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cmtr1Q9DBC3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cmtr1Q9DBC3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cmtr1Q9DBC3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cmtr1Q9DBC3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cmtr1Q9DBC3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cmtr1Q9DBC3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cmtr1Q9DBC3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cmtr1Q9DBC3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cmtr1Q9DBC3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cmtr1Q9DBC3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cmtr1Q9DBC3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cmtr1Q9DBC3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cmtr1Q9DBC3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cmtr1Q9DBC3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cmtr1Q9DBC3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cmtr1Q9DBC3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cmtr1Q9DBC3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cmtr1Q9DBC3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cmtr1Q9DBC3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cmtr1Q9DBC3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cmtr1Q9DBC3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cmtr1Q9DBC3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cmtr1Q9DBC3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cmtr1Q9DBC3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cmtr1Q9DBC3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cmtr1Q9DBC3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cmtr1Q9DBC3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cmtr1Q9DBC3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cmtr1Q9DBC3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cmtr1Q9DBC3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cmtr1Q9DBC3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cmtr1Q9DBC3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cmtr1Q9DBC3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cmtr1Q9DBC3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cmtr1Q9DBC3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cmtr1Q9DBC3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cmtr1Q9DBC3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cmtr1Q9DBC3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cmtr1Q9DBC3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cmtr1Q9DBC3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cmtr1Q9DBC3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cmtr1Q9DBC3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cmtr1Q9DBC3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cmtr1Q9DBC3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cmtr1Q9DBC3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cmtr1Q9DBC3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cmtr1Q9DBC3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cmtr1Q9DBC3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cmtr1Q9DBC3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cmtr1Q9DBC3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cmtr1Q9DBC3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cmtr1Q9DBC3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cmtr1Q9DBC3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cmtr1Q9DBC3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cmtr1Q9DBC3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cmtr1Q9DBC3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cmtr1Q9DBC3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cmtr1Q9DBC3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cmtr1Q9DBC3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cmtr1Q9DBC3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cmtr1Q9DBC3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cmtr1Q9DBC3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cmtr1Q9DBC3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cmtr1Q9DBC3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cmtr1Q9DBC3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cmtr1Q9DBC3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cmtr1Q9DBC3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cmtr1Q9DBC3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cmtr1Q9DBC3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cmtr1Q9DBC3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cmtr1Q9DBC3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cmtr1Q9DBC3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cmtr1Q9DBC3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cmtr1Q9DBC3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cmtr1Q9DBC3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cmtr1Q9DBC3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cmtr1Q9DBC3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cmtr1Q9DBC3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cmtr1Q9DBC3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cmtr1Q9DBC3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cmtr1Q9DBC3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cmtr1Q9DBC3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cmtr1Q9DBC3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cmtr1Q9DBC3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cmtr1Q9DBC3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cmtr1Q9DBC3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cmtr1Q9DBC3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cmtr1Q9DBC3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cmtr1Q9DBC3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cmtr1Q9DBC3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cmtr1Q9DBC3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cmtr1Q9DBC3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cmtr1Q9DBC3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cmtr1Q9DBC3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cmtr1Q9DBC3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms