Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA83

1700018B08Rik, RIKEN cDNA 1700018B08, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018B08RikQ9DA83 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
1700018B08RikQ9DA83 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
1700018B08RikQ9DA83 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
1700018B08RikQ9DA83 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
1700018B08RikQ9DA83 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
1700018B08RikQ9DA83 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
1700018B08RikQ9DA83 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
1700018B08RikQ9DA83 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
1700018B08RikQ9DA83 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
1700018B08RikQ9DA83 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
1700018B08RikQ9DA83 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
1700018B08RikQ9DA83 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
1700018B08RikQ9DA83 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
1700018B08RikQ9DA83 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
1700018B08RikQ9DA83 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
1700018B08RikQ9DA83 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
1700018B08RikQ9DA83 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
1700018B08RikQ9DA83 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
1700018B08RikQ9DA83 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
1700018B08RikQ9DA83 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
1700018B08RikQ9DA83 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
1700018B08RikQ9DA83 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
1700018B08RikQ9DA83 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
1700018B08RikQ9DA83 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
1700018B08RikQ9DA83 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
1700018B08RikQ9DA83 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
1700018B08RikQ9DA83 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
1700018B08RikQ9DA83 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
1700018B08RikQ9DA83 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
1700018B08RikQ9DA83 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
1700018B08RikQ9DA83 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
1700018B08RikQ9DA83 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
1700018B08RikQ9DA83 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
1700018B08RikQ9DA83 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
1700018B08RikQ9DA83 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
1700018B08RikQ9DA83 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
1700018B08RikQ9DA83 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
1700018B08RikQ9DA83 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
1700018B08RikQ9DA83 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
1700018B08RikQ9DA83 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
1700018B08RikQ9DA83 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
1700018B08RikQ9DA83 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
1700018B08RikQ9DA83 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
1700018B08RikQ9DA83 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
1700018B08RikQ9DA83 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
1700018B08RikQ9DA83 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
1700018B08RikQ9DA83 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
1700018B08RikQ9DA83 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
1700018B08RikQ9DA83 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
1700018B08RikQ9DA83 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
1700018B08RikQ9DA83 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
1700018B08RikQ9DA83 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
1700018B08RikQ9DA83 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
1700018B08RikQ9DA83 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
1700018B08RikQ9DA83 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
1700018B08RikQ9DA83 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
1700018B08RikQ9DA83 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
1700018B08RikQ9DA83 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
1700018B08RikQ9DA83 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
1700018B08RikQ9DA83 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
1700018B08RikQ9DA83 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
1700018B08RikQ9DA83 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
1700018B08RikQ9DA83 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
1700018B08RikQ9DA83 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
1700018B08RikQ9DA83 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
1700018B08RikQ9DA83 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
1700018B08RikQ9DA83 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
1700018B08RikQ9DA83 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
1700018B08RikQ9DA83 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
1700018B08RikQ9DA83 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
1700018B08RikQ9DA83 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
1700018B08RikQ9DA83 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
1700018B08RikQ9DA83 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
1700018B08RikQ9DA83 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
1700018B08RikQ9DA83 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
1700018B08RikQ9DA83 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
1700018B08RikQ9DA83 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
1700018B08RikQ9DA83 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
1700018B08RikQ9DA83 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
1700018B08RikQ9DA83 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
1700018B08RikQ9DA83 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
1700018B08RikQ9DA83 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
1700018B08RikQ9DA83 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
1700018B08RikQ9DA83 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
1700018B08RikQ9DA83 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
1700018B08RikQ9DA83 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
1700018B08RikQ9DA83 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
1700018B08RikQ9DA83 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
1700018B08RikQ9DA83 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
1700018B08RikQ9DA83 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
1700018B08RikQ9DA83 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
1700018B08RikQ9DA83 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
1700018B08RikQ9DA83 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
1700018B08RikQ9DA83 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
1700018B08RikQ9DA83 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
1700018B08RikQ9DA83 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
1700018B08RikQ9DA83 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
1700018B08RikQ9DA83 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
1700018B08RikQ9DA83 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
1700018B08RikQ9DA83 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms