Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Q6

Calr3, Calreticulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr3Q9D9Q6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calr3Q9D9Q6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calr3Q9D9Q6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calr3Q9D9Q6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Calr3Q9D9Q6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Calr3Q9D9Q6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Calr3Q9D9Q6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Calr3Q9D9Q6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Calr3Q9D9Q6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calr3Q9D9Q6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calr3Q9D9Q6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calr3Q9D9Q6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calr3Q9D9Q6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calr3Q9D9Q6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calr3Q9D9Q6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calr3Q9D9Q6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calr3Q9D9Q6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calr3Q9D9Q6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calr3Q9D9Q6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calr3Q9D9Q6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calr3Q9D9Q6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calr3Q9D9Q6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calr3Q9D9Q6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Calr3Q9D9Q6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calr3Q9D9Q6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calr3Q9D9Q6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Calr3Q9D9Q6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Calr3Q9D9Q6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Calr3Q9D9Q6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Calr3Q9D9Q6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Calr3Q9D9Q6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Calr3Q9D9Q6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Calr3Q9D9Q6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calr3Q9D9Q6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calr3Q9D9Q6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calr3Q9D9Q6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calr3Q9D9Q6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calr3Q9D9Q6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calr3Q9D9Q6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calr3Q9D9Q6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calr3Q9D9Q6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calr3Q9D9Q6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Calr3Q9D9Q6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calr3Q9D9Q6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calr3Q9D9Q6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calr3Q9D9Q6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Calr3Q9D9Q6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calr3Q9D9Q6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calr3Q9D9Q6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calr3Q9D9Q6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Calr3Q9D9Q6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calr3Q9D9Q6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Calr3Q9D9Q6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calr3Q9D9Q6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calr3Q9D9Q6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calr3Q9D9Q6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calr3Q9D9Q6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calr3Q9D9Q6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calr3Q9D9Q6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calr3Q9D9Q6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calr3Q9D9Q6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calr3Q9D9Q6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calr3Q9D9Q6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calr3Q9D9Q6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calr3Q9D9Q6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calr3Q9D9Q6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calr3Q9D9Q6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calr3Q9D9Q6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calr3Q9D9Q6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calr3Q9D9Q6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calr3Q9D9Q6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calr3Q9D9Q6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calr3Q9D9Q6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calr3Q9D9Q6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calr3Q9D9Q6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calr3Q9D9Q6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calr3Q9D9Q6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calr3Q9D9Q6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calr3Q9D9Q6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calr3Q9D9Q6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calr3Q9D9Q6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calr3Q9D9Q6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calr3Q9D9Q6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calr3Q9D9Q6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calr3Q9D9Q6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calr3Q9D9Q6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calr3Q9D9Q6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calr3Q9D9Q6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calr3Q9D9Q6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calr3Q9D9Q6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calr3Q9D9Q6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calr3Q9D9Q6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calr3Q9D9Q6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Calr3Q9D9Q6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calr3Q9D9Q6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calr3Q9D9Q6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calr3Q9D9Q6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calr3Q9D9Q6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calr3Q9D9Q6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calr3Q9D9Q6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms