Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9P2

Ccdc103, Coiled-coil domain-containing protein 103, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc103Q9D9P2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc103Q9D9P2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc103Q9D9P2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc103Q9D9P2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc103Q9D9P2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc103Q9D9P2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc103Q9D9P2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc103Q9D9P2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc103Q9D9P2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc103Q9D9P2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc103Q9D9P2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc103Q9D9P2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc103Q9D9P2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc103Q9D9P2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc103Q9D9P2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc103Q9D9P2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc103Q9D9P2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc103Q9D9P2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc103Q9D9P2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc103Q9D9P2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc103Q9D9P2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc103Q9D9P2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc103Q9D9P2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc103Q9D9P2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc103Q9D9P2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc103Q9D9P2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc103Q9D9P2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc103Q9D9P2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc103Q9D9P2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc103Q9D9P2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc103Q9D9P2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc103Q9D9P2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc103Q9D9P2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc103Q9D9P2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc103Q9D9P2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc103Q9D9P2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc103Q9D9P2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc103Q9D9P2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc103Q9D9P2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc103Q9D9P2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc103Q9D9P2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc103Q9D9P2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc103Q9D9P2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc103Q9D9P2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc103Q9D9P2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc103Q9D9P2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc103Q9D9P2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc103Q9D9P2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc103Q9D9P2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc103Q9D9P2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc103Q9D9P2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc103Q9D9P2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc103Q9D9P2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc103Q9D9P2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc103Q9D9P2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc103Q9D9P2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc103Q9D9P2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc103Q9D9P2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc103Q9D9P2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc103Q9D9P2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc103Q9D9P2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc103Q9D9P2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc103Q9D9P2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc103Q9D9P2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc103Q9D9P2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc103Q9D9P2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc103Q9D9P2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc103Q9D9P2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc103Q9D9P2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc103Q9D9P2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc103Q9D9P2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc103Q9D9P2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc103Q9D9P2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc103Q9D9P2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc103Q9D9P2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc103Q9D9P2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc103Q9D9P2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc103Q9D9P2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc103Q9D9P2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc103Q9D9P2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc103Q9D9P2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc103Q9D9P2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc103Q9D9P2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc103Q9D9P2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc103Q9D9P2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc103Q9D9P2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc103Q9D9P2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc103Q9D9P2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc103Q9D9P2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc103Q9D9P2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc103Q9D9P2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc103Q9D9P2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc103Q9D9P2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc103Q9D9P2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc103Q9D9P2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc103Q9D9P2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc103Q9D9P2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc103Q9D9P2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc103Q9D9P2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc103Q9D9P2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms