Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tubb4aQ9D6F9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tubb4aQ9D6F9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tubb4aQ9D6F9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tubb4aQ9D6F9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tubb4aQ9D6F9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tubb4aQ9D6F9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tubb4aQ9D6F9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tubb4aQ9D6F9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tubb4aQ9D6F9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tubb4aQ9D6F9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tubb4aQ9D6F9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tubb4aQ9D6F9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tubb4aQ9D6F9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tubb4aQ9D6F9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tubb4aQ9D6F9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tubb4aQ9D6F9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tubb4aQ9D6F9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tubb4aQ9D6F9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tubb4aQ9D6F9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tubb4aQ9D6F9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tubb4aQ9D6F9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tubb4aQ9D6F9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tubb4aQ9D6F9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tubb4aQ9D6F9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tubb4aQ9D6F9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tubb4aQ9D6F9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tubb4aQ9D6F9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tubb4aQ9D6F9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tubb4aQ9D6F9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tubb4aQ9D6F9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tubb4aQ9D6F9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tubb4aQ9D6F9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tubb4aQ9D6F9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tubb4aQ9D6F9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tubb4aQ9D6F9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tubb4aQ9D6F9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tubb4aQ9D6F9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubb4aQ9D6F9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubb4aQ9D6F9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubb4aQ9D6F9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubb4aQ9D6F9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubb4aQ9D6F9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubb4aQ9D6F9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubb4aQ9D6F9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubb4aQ9D6F9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubb4aQ9D6F9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubb4aQ9D6F9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubb4aQ9D6F9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubb4aQ9D6F9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubb4aQ9D6F9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubb4aQ9D6F9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubb4aQ9D6F9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubb4aQ9D6F9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubb4aQ9D6F9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubb4aQ9D6F9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubb4aQ9D6F9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubb4aQ9D6F9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubb4aQ9D6F9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubb4aQ9D6F9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubb4aQ9D6F9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Tubb4aQ9D6F9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tubb4aQ9D6F9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubb4aQ9D6F9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubb4aQ9D6F9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubb4aQ9D6F9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubb4aQ9D6F9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubb4aQ9D6F9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubb4aQ9D6F9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubb4aQ9D6F9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubb4aQ9D6F9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubb4aQ9D6F9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubb4aQ9D6F9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubb4aQ9D6F9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubb4aQ9D6F9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubb4aQ9D6F9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubb4aQ9D6F9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubb4aQ9D6F9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubb4aQ9D6F9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubb4aQ9D6F9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubb4aQ9D6F9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubb4aQ9D6F9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubb4aQ9D6F9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubb4aQ9D6F9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubb4aQ9D6F9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubb4aQ9D6F9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubb4aQ9D6F9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubb4aQ9D6F9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubb4aQ9D6F9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubb4aQ9D6F9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubb4aQ9D6F9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubb4aQ9D6F9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubb4aQ9D6F9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubb4aQ9D6F9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubb4aQ9D6F9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubb4aQ9D6F9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubb4aQ9D6F9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubb4aQ9D6F9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubb4aQ9D6F9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubb4aQ9D6F9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms