Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc81Q9D5W4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc81Q9D5W4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc81Q9D5W4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc81Q9D5W4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc81Q9D5W4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc81Q9D5W4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc81Q9D5W4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc81Q9D5W4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc81Q9D5W4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc81Q9D5W4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc81Q9D5W4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc81Q9D5W4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc81Q9D5W4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc81Q9D5W4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc81Q9D5W4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc81Q9D5W4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc81Q9D5W4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc81Q9D5W4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc81Q9D5W4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc81Q9D5W4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc81Q9D5W4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc81Q9D5W4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc81Q9D5W4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc81Q9D5W4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc81Q9D5W4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc81Q9D5W4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc81Q9D5W4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc81Q9D5W4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc81Q9D5W4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc81Q9D5W4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc81Q9D5W4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc81Q9D5W4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc81Q9D5W4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc81Q9D5W4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc81Q9D5W4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc81Q9D5W4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc81Q9D5W4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc81Q9D5W4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc81Q9D5W4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc81Q9D5W4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc81Q9D5W4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc81Q9D5W4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc81Q9D5W4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc81Q9D5W4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc81Q9D5W4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc81Q9D5W4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc81Q9D5W4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc81Q9D5W4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc81Q9D5W4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc81Q9D5W4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc81Q9D5W4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc81Q9D5W4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc81Q9D5W4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc81Q9D5W4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc81Q9D5W4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc81Q9D5W4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc81Q9D5W4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc81Q9D5W4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc81Q9D5W4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc81Q9D5W4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc81Q9D5W4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc81Q9D5W4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc81Q9D5W4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc81Q9D5W4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc81Q9D5W4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc81Q9D5W4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc81Q9D5W4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc81Q9D5W4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc81Q9D5W4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc81Q9D5W4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc81Q9D5W4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc81Q9D5W4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc81Q9D5W4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc81Q9D5W4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc81Q9D5W4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc81Q9D5W4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc81Q9D5W4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc81Q9D5W4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc81Q9D5W4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc81Q9D5W4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc81Q9D5W4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc81Q9D5W4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc81Q9D5W4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc81Q9D5W4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc81Q9D5W4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc81Q9D5W4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc81Q9D5W4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc81Q9D5W4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc81Q9D5W4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc81Q9D5W4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc81Q9D5W4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc81Q9D5W4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc81Q9D5W4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc81Q9D5W4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc81Q9D5W4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc81Q9D5W4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc81Q9D5W4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc81Q9D5W4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc81Q9D5W4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms