Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc83Q9D4V3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc83Q9D4V3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc83Q9D4V3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc83Q9D4V3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc83Q9D4V3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc83Q9D4V3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc83Q9D4V3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc83Q9D4V3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc83Q9D4V3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc83Q9D4V3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc83Q9D4V3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc83Q9D4V3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc83Q9D4V3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc83Q9D4V3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc83Q9D4V3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc83Q9D4V3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc83Q9D4V3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc83Q9D4V3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc83Q9D4V3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc83Q9D4V3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc83Q9D4V3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc83Q9D4V3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc83Q9D4V3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc83Q9D4V3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc83Q9D4V3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc83Q9D4V3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc83Q9D4V3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc83Q9D4V3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc83Q9D4V3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc83Q9D4V3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc83Q9D4V3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc83Q9D4V3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc83Q9D4V3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc83Q9D4V3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc83Q9D4V3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc83Q9D4V3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc83Q9D4V3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc83Q9D4V3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc83Q9D4V3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc83Q9D4V3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc83Q9D4V3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc83Q9D4V3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc83Q9D4V3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc83Q9D4V3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc83Q9D4V3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc83Q9D4V3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc83Q9D4V3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms