Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933428M09RikQ9D3X3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933428M09RikQ9D3X3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933428M09RikQ9D3X3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933428M09RikQ9D3X3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933428M09RikQ9D3X3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933428M09RikQ9D3X3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933428M09RikQ9D3X3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4933428M09RikQ9D3X3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933428M09RikQ9D3X3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933428M09RikQ9D3X3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933428M09RikQ9D3X3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933428M09RikQ9D3X3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933428M09RikQ9D3X3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933428M09RikQ9D3X3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.29■■□□□ 1
4933428M09RikQ9D3X3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4933428M09RikQ9D3X3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933428M09RikQ9D3X3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933428M09RikQ9D3X3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933428M09RikQ9D3X3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933428M09RikQ9D3X3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
4933428M09RikQ9D3X3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933428M09RikQ9D3X3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
4933428M09RikQ9D3X3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933428M09RikQ9D3X3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933428M09RikQ9D3X3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933428M09RikQ9D3X3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933428M09RikQ9D3X3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933428M09RikQ9D3X3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933428M09RikQ9D3X3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933428M09RikQ9D3X3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933428M09RikQ9D3X3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933428M09RikQ9D3X3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933428M09RikQ9D3X3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933428M09RikQ9D3X3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933428M09RikQ9D3X3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933428M09RikQ9D3X3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933428M09RikQ9D3X3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933428M09RikQ9D3X3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933428M09RikQ9D3X3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933428M09RikQ9D3X3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933428M09RikQ9D3X3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933428M09RikQ9D3X3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933428M09RikQ9D3X3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933428M09RikQ9D3X3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933428M09RikQ9D3X3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933428M09RikQ9D3X3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933428M09RikQ9D3X3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933428M09RikQ9D3X3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933428M09RikQ9D3X3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933428M09RikQ9D3X3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
4933428M09RikQ9D3X3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
4933428M09RikQ9D3X3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4933428M09RikQ9D3X3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4933428M09RikQ9D3X3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4933428M09RikQ9D3X3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4933428M09RikQ9D3X3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4933428M09RikQ9D3X3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4933428M09RikQ9D3X3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4933428M09RikQ9D3X3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4933428M09RikQ9D3X3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4933428M09RikQ9D3X3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4933428M09RikQ9D3X3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4933428M09RikQ9D3X3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4933428M09RikQ9D3X3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
4933428M09RikQ9D3X3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
4933428M09RikQ9D3X3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
4933428M09RikQ9D3X3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4933428M09RikQ9D3X3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
4933428M09RikQ9D3X3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933428M09RikQ9D3X3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933428M09RikQ9D3X3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933428M09RikQ9D3X3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933428M09RikQ9D3X3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933428M09RikQ9D3X3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933428M09RikQ9D3X3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933428M09RikQ9D3X3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4933428M09RikQ9D3X3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4933428M09RikQ9D3X3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
4933428M09RikQ9D3X3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
4933428M09RikQ9D3X3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
4933428M09RikQ9D3X3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
4933428M09RikQ9D3X3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
4933428M09RikQ9D3X3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
4933428M09RikQ9D3X3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
4933428M09RikQ9D3X3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
4933428M09RikQ9D3X3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4933428M09RikQ9D3X3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4933428M09RikQ9D3X3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4933428M09RikQ9D3X3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4933428M09RikQ9D3X3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
4933428M09RikQ9D3X3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933428M09RikQ9D3X3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933428M09RikQ9D3X3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms