Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3V5

Fsip1, Fibrous sheath-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fsip1Q9D3V5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fsip1Q9D3V5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fsip1Q9D3V5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fsip1Q9D3V5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fsip1Q9D3V5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fsip1Q9D3V5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fsip1Q9D3V5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Fsip1Q9D3V5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Fsip1Q9D3V5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fsip1Q9D3V5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fsip1Q9D3V5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fsip1Q9D3V5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fsip1Q9D3V5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Fsip1Q9D3V5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Fsip1Q9D3V5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fsip1Q9D3V5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fsip1Q9D3V5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fsip1Q9D3V5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fsip1Q9D3V5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fsip1Q9D3V5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fsip1Q9D3V5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fsip1Q9D3V5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fsip1Q9D3V5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fsip1Q9D3V5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fsip1Q9D3V5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fsip1Q9D3V5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fsip1Q9D3V5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fsip1Q9D3V5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fsip1Q9D3V5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fsip1Q9D3V5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fsip1Q9D3V5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fsip1Q9D3V5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fsip1Q9D3V5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fsip1Q9D3V5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fsip1Q9D3V5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fsip1Q9D3V5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fsip1Q9D3V5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fsip1Q9D3V5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fsip1Q9D3V5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fsip1Q9D3V5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fsip1Q9D3V5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fsip1Q9D3V5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fsip1Q9D3V5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fsip1Q9D3V5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fsip1Q9D3V5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fsip1Q9D3V5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fsip1Q9D3V5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fsip1Q9D3V5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fsip1Q9D3V5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fsip1Q9D3V5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fsip1Q9D3V5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fsip1Q9D3V5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fsip1Q9D3V5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fsip1Q9D3V5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fsip1Q9D3V5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fsip1Q9D3V5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fsip1Q9D3V5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fsip1Q9D3V5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fsip1Q9D3V5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fsip1Q9D3V5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Fsip1Q9D3V5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fsip1Q9D3V5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fsip1Q9D3V5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fsip1Q9D3V5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fsip1Q9D3V5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fsip1Q9D3V5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fsip1Q9D3V5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fsip1Q9D3V5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Fsip1Q9D3V5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fsip1Q9D3V5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fsip1Q9D3V5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fsip1Q9D3V5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fsip1Q9D3V5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fsip1Q9D3V5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fsip1Q9D3V5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fsip1Q9D3V5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fsip1Q9D3V5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fsip1Q9D3V5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fsip1Q9D3V5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fsip1Q9D3V5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fsip1Q9D3V5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fsip1Q9D3V5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fsip1Q9D3V5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fsip1Q9D3V5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fsip1Q9D3V5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fsip1Q9D3V5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fsip1Q9D3V5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fsip1Q9D3V5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fsip1Q9D3V5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fsip1Q9D3V5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fsip1Q9D3V5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fsip1Q9D3V5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fsip1Q9D3V5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fsip1Q9D3V5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fsip1Q9D3V5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fsip1Q9D3V5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fsip1Q9D3V5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fsip1Q9D3V5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fsip1Q9D3V5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fsip1Q9D3V5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms