Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R6

Katnal2, Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnal2Q9D3R6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Katnal2Q9D3R6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Katnal2Q9D3R6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Katnal2Q9D3R6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Katnal2Q9D3R6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Katnal2Q9D3R6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Katnal2Q9D3R6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Katnal2Q9D3R6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Katnal2Q9D3R6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Katnal2Q9D3R6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Katnal2Q9D3R6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Katnal2Q9D3R6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Katnal2Q9D3R6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Katnal2Q9D3R6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Katnal2Q9D3R6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
Katnal2Q9D3R6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Katnal2Q9D3R6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Katnal2Q9D3R6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Katnal2Q9D3R6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Katnal2Q9D3R6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Katnal2Q9D3R6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Katnal2Q9D3R6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Katnal2Q9D3R6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Katnal2Q9D3R6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Katnal2Q9D3R6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Katnal2Q9D3R6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Katnal2Q9D3R6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Katnal2Q9D3R6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Katnal2Q9D3R6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Katnal2Q9D3R6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Katnal2Q9D3R6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Katnal2Q9D3R6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Katnal2Q9D3R6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Katnal2Q9D3R6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Katnal2Q9D3R6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Katnal2Q9D3R6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Katnal2Q9D3R6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Katnal2Q9D3R6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Katnal2Q9D3R6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Katnal2Q9D3R6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Katnal2Q9D3R6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Katnal2Q9D3R6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Katnal2Q9D3R6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Katnal2Q9D3R6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Katnal2Q9D3R6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Katnal2Q9D3R6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Katnal2Q9D3R6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Katnal2Q9D3R6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Katnal2Q9D3R6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Katnal2Q9D3R6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Katnal2Q9D3R6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Katnal2Q9D3R6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Katnal2Q9D3R6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Katnal2Q9D3R6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Katnal2Q9D3R6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Katnal2Q9D3R6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Katnal2Q9D3R6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Katnal2Q9D3R6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Katnal2Q9D3R6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Katnal2Q9D3R6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Katnal2Q9D3R6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Katnal2Q9D3R6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Katnal2Q9D3R6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Katnal2Q9D3R6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Katnal2Q9D3R6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Katnal2Q9D3R6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Katnal2Q9D3R6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Katnal2Q9D3R6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Katnal2Q9D3R6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Katnal2Q9D3R6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Katnal2Q9D3R6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Katnal2Q9D3R6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Katnal2Q9D3R6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Katnal2Q9D3R6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Katnal2Q9D3R6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Katnal2Q9D3R6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Katnal2Q9D3R6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Katnal2Q9D3R6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Katnal2Q9D3R6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Katnal2Q9D3R6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Katnal2Q9D3R6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Katnal2Q9D3R6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Katnal2Q9D3R6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Katnal2Q9D3R6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Katnal2Q9D3R6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Katnal2Q9D3R6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Katnal2Q9D3R6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Katnal2Q9D3R6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Katnal2Q9D3R6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Katnal2Q9D3R6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Katnal2Q9D3R6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Katnal2Q9D3R6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Katnal2Q9D3R6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Katnal2Q9D3R6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Katnal2Q9D3R6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Katnal2Q9D3R6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Katnal2Q9D3R6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Katnal2Q9D3R6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Katnal2Q9D3R6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Katnal2Q9D3R6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms