Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stag1Q9D3E6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stag1Q9D3E6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stag1Q9D3E6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stag1Q9D3E6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stag1Q9D3E6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Stag1Q9D3E6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Stag1Q9D3E6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Stag1Q9D3E6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Stag1Q9D3E6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Stag1Q9D3E6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Stag1Q9D3E6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stag1Q9D3E6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stag1Q9D3E6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Stag1Q9D3E6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stag1Q9D3E6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stag1Q9D3E6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stag1Q9D3E6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stag1Q9D3E6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stag1Q9D3E6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stag1Q9D3E6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stag1Q9D3E6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Stag1Q9D3E6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Stag1Q9D3E6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Stag1Q9D3E6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Stag1Q9D3E6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Stag1Q9D3E6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Stag1Q9D3E6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Stag1Q9D3E6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Stag1Q9D3E6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Stag1Q9D3E6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Stag1Q9D3E6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Stag1Q9D3E6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Stag1Q9D3E6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Stag1Q9D3E6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Stag1Q9D3E6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Stag1Q9D3E6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Stag1Q9D3E6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Stag1Q9D3E6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Stag1Q9D3E6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Stag1Q9D3E6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Stag1Q9D3E6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Stag1Q9D3E6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Stag1Q9D3E6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Stag1Q9D3E6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Stag1Q9D3E6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Stag1Q9D3E6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Stag1Q9D3E6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Stag1Q9D3E6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Stag1Q9D3E6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Stag1Q9D3E6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Stag1Q9D3E6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Stag1Q9D3E6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Stag1Q9D3E6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Stag1Q9D3E6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Stag1Q9D3E6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Stag1Q9D3E6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Stag1Q9D3E6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Stag1Q9D3E6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Stag1Q9D3E6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Stag1Q9D3E6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Stag1Q9D3E6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Stag1Q9D3E6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Stag1Q9D3E6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Stag1Q9D3E6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Stag1Q9D3E6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Stag1Q9D3E6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Stag1Q9D3E6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Stag1Q9D3E6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Stag1Q9D3E6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Stag1Q9D3E6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Stag1Q9D3E6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Stag1Q9D3E6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Stag1Q9D3E6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Stag1Q9D3E6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Stag1Q9D3E6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Stag1Q9D3E6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Stag1Q9D3E6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Stag1Q9D3E6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Stag1Q9D3E6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Stag1Q9D3E6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Stag1Q9D3E6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Stag1Q9D3E6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Stag1Q9D3E6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Stag1Q9D3E6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Stag1Q9D3E6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Stag1Q9D3E6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Stag1Q9D3E6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Stag1Q9D3E6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Stag1Q9D3E6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Stag1Q9D3E6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Stag1Q9D3E6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Stag1Q9D3E6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Stag1Q9D3E6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Stag1Q9D3E6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Stag1Q9D3E6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Stag1Q9D3E6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Stag1Q9D3E6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Stag1Q9D3E6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Stag1Q9D3E6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms