Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vsig1Q9D2J4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vsig1Q9D2J4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Vsig1Q9D2J4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Vsig1Q9D2J4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vsig1Q9D2J4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vsig1Q9D2J4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vsig1Q9D2J4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vsig1Q9D2J4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vsig1Q9D2J4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vsig1Q9D2J4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vsig1Q9D2J4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vsig1Q9D2J4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vsig1Q9D2J4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vsig1Q9D2J4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vsig1Q9D2J4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vsig1Q9D2J4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vsig1Q9D2J4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vsig1Q9D2J4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Vsig1Q9D2J4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vsig1Q9D2J4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vsig1Q9D2J4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vsig1Q9D2J4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vsig1Q9D2J4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vsig1Q9D2J4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vsig1Q9D2J4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vsig1Q9D2J4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vsig1Q9D2J4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vsig1Q9D2J4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vsig1Q9D2J4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vsig1Q9D2J4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vsig1Q9D2J4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vsig1Q9D2J4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vsig1Q9D2J4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vsig1Q9D2J4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vsig1Q9D2J4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vsig1Q9D2J4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vsig1Q9D2J4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Vsig1Q9D2J4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vsig1Q9D2J4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vsig1Q9D2J4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vsig1Q9D2J4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vsig1Q9D2J4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vsig1Q9D2J4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vsig1Q9D2J4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vsig1Q9D2J4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vsig1Q9D2J4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vsig1Q9D2J4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vsig1Q9D2J4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vsig1Q9D2J4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vsig1Q9D2J4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vsig1Q9D2J4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vsig1Q9D2J4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vsig1Q9D2J4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vsig1Q9D2J4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vsig1Q9D2J4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vsig1Q9D2J4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vsig1Q9D2J4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vsig1Q9D2J4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vsig1Q9D2J4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vsig1Q9D2J4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vsig1Q9D2J4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vsig1Q9D2J4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Vsig1Q9D2J4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vsig1Q9D2J4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vsig1Q9D2J4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vsig1Q9D2J4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vsig1Q9D2J4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vsig1Q9D2J4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vsig1Q9D2J4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vsig1Q9D2J4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vsig1Q9D2J4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms