Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pramef12Q9D2F1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pramef12Q9D2F1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pramef12Q9D2F1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pramef12Q9D2F1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pramef12Q9D2F1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pramef12Q9D2F1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pramef12Q9D2F1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pramef12Q9D2F1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pramef12Q9D2F1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pramef12Q9D2F1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pramef12Q9D2F1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pramef12Q9D2F1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pramef12Q9D2F1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pramef12Q9D2F1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pramef12Q9D2F1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pramef12Q9D2F1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pramef12Q9D2F1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pramef12Q9D2F1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pramef12Q9D2F1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pramef12Q9D2F1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pramef12Q9D2F1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pramef12Q9D2F1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pramef12Q9D2F1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pramef12Q9D2F1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pramef12Q9D2F1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pramef12Q9D2F1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pramef12Q9D2F1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pramef12Q9D2F1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pramef12Q9D2F1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pramef12Q9D2F1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pramef12Q9D2F1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pramef12Q9D2F1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pramef12Q9D2F1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pramef12Q9D2F1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pramef12Q9D2F1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pramef12Q9D2F1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pramef12Q9D2F1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pramef12Q9D2F1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pramef12Q9D2F1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pramef12Q9D2F1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pramef12Q9D2F1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pramef12Q9D2F1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pramef12Q9D2F1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pramef12Q9D2F1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pramef12Q9D2F1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pramef12Q9D2F1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Pramef12Q9D2F1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pramef12Q9D2F1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pramef12Q9D2F1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pramef12Q9D2F1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pramef12Q9D2F1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pramef12Q9D2F1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pramef12Q9D2F1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pramef12Q9D2F1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pramef12Q9D2F1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pramef12Q9D2F1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.6 ms