Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Z3

Fam173b, Protein FAM173B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam173bQ9D1Z3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam173bQ9D1Z3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam173bQ9D1Z3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam173bQ9D1Z3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam173bQ9D1Z3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam173bQ9D1Z3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam173bQ9D1Z3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam173bQ9D1Z3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam173bQ9D1Z3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam173bQ9D1Z3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam173bQ9D1Z3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam173bQ9D1Z3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam173bQ9D1Z3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam173bQ9D1Z3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam173bQ9D1Z3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam173bQ9D1Z3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam173bQ9D1Z3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam173bQ9D1Z3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam173bQ9D1Z3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam173bQ9D1Z3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam173bQ9D1Z3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam173bQ9D1Z3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam173bQ9D1Z3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam173bQ9D1Z3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam173bQ9D1Z3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam173bQ9D1Z3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam173bQ9D1Z3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam173bQ9D1Z3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam173bQ9D1Z3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam173bQ9D1Z3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam173bQ9D1Z3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam173bQ9D1Z3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam173bQ9D1Z3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam173bQ9D1Z3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam173bQ9D1Z3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam173bQ9D1Z3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam173bQ9D1Z3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam173bQ9D1Z3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam173bQ9D1Z3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam173bQ9D1Z3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam173bQ9D1Z3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam173bQ9D1Z3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam173bQ9D1Z3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam173bQ9D1Z3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam173bQ9D1Z3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam173bQ9D1Z3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam173bQ9D1Z3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam173bQ9D1Z3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam173bQ9D1Z3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam173bQ9D1Z3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam173bQ9D1Z3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam173bQ9D1Z3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam173bQ9D1Z3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam173bQ9D1Z3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam173bQ9D1Z3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam173bQ9D1Z3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam173bQ9D1Z3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam173bQ9D1Z3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam173bQ9D1Z3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam173bQ9D1Z3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam173bQ9D1Z3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam173bQ9D1Z3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam173bQ9D1Z3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam173bQ9D1Z3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam173bQ9D1Z3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam173bQ9D1Z3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam173bQ9D1Z3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam173bQ9D1Z3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam173bQ9D1Z3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam173bQ9D1Z3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam173bQ9D1Z3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam173bQ9D1Z3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam173bQ9D1Z3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam173bQ9D1Z3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam173bQ9D1Z3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam173bQ9D1Z3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam173bQ9D1Z3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam173bQ9D1Z3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam173bQ9D1Z3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam173bQ9D1Z3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam173bQ9D1Z3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam173bQ9D1Z3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam173bQ9D1Z3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam173bQ9D1Z3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam173bQ9D1Z3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam173bQ9D1Z3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam173bQ9D1Z3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam173bQ9D1Z3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam173bQ9D1Z3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam173bQ9D1Z3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam173bQ9D1Z3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam173bQ9D1Z3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam173bQ9D1Z3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam173bQ9D1Z3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam173bQ9D1Z3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam173bQ9D1Z3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam173bQ9D1Z3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam173bQ9D1Z3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam173bQ9D1Z3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam173bQ9D1Z3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms