Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1R9

Rpl34, 60S ribosomal protein L34, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl34Q9D1R9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpl34Q9D1R9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpl34Q9D1R9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpl34Q9D1R9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpl34Q9D1R9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpl34Q9D1R9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpl34Q9D1R9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpl34Q9D1R9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpl34Q9D1R9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpl34Q9D1R9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpl34Q9D1R9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpl34Q9D1R9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpl34Q9D1R9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpl34Q9D1R9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpl34Q9D1R9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpl34Q9D1R9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpl34Q9D1R9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpl34Q9D1R9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpl34Q9D1R9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl34Q9D1R9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl34Q9D1R9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl34Q9D1R9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl34Q9D1R9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl34Q9D1R9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl34Q9D1R9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl34Q9D1R9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl34Q9D1R9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpl34Q9D1R9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpl34Q9D1R9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpl34Q9D1R9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl34Q9D1R9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl34Q9D1R9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl34Q9D1R9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl34Q9D1R9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl34Q9D1R9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl34Q9D1R9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl34Q9D1R9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl34Q9D1R9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl34Q9D1R9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl34Q9D1R9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl34Q9D1R9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rpl34Q9D1R9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rpl34Q9D1R9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpl34Q9D1R9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpl34Q9D1R9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpl34Q9D1R9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpl34Q9D1R9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpl34Q9D1R9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpl34Q9D1R9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpl34Q9D1R9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpl34Q9D1R9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpl34Q9D1R9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpl34Q9D1R9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpl34Q9D1R9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpl34Q9D1R9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpl34Q9D1R9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpl34Q9D1R9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpl34Q9D1R9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpl34Q9D1R9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpl34Q9D1R9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpl34Q9D1R9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpl34Q9D1R9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpl34Q9D1R9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpl34Q9D1R9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpl34Q9D1R9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpl34Q9D1R9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpl34Q9D1R9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rpl34Q9D1R9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rpl34Q9D1R9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rpl34Q9D1R9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpl34Q9D1R9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpl34Q9D1R9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpl34Q9D1R9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpl34Q9D1R9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl34Q9D1R9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl34Q9D1R9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl34Q9D1R9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl34Q9D1R9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl34Q9D1R9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl34Q9D1R9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl34Q9D1R9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpl34Q9D1R9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpl34Q9D1R9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpl34Q9D1R9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpl34Q9D1R9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpl34Q9D1R9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl34Q9D1R9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl34Q9D1R9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl34Q9D1R9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl34Q9D1R9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl34Q9D1R9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl34Q9D1R9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl34Q9D1R9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl34Q9D1R9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpl34Q9D1R9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpl34Q9D1R9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpl34Q9D1R9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpl34Q9D1R9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpl34Q9D1R9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpl34Q9D1R9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms