Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9D1F3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9D1F3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9D1F3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9D1F3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9D1F3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9D1F3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9D1F3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9D1F3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9D1F3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9D1F3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9D1F3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9D1F3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9D1F3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9D1F3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9D1F3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9D1F3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9D1F3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9D1F3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9D1F3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9D1F3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9D1F3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D1F3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D1F3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D1F3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D1F3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D1F3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D1F3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9D1F3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9D1F3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Q9D1F3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9D1F3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9D1F3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9D1F3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D1F3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D1F3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D1F3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D1F3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D1F3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D1F3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D1F3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D1F3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D1F3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D1F3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D1F3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D1F3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D1F3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D1F3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D1F3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D1F3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D1F3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D1F3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D1F3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D1F3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D1F3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D1F3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D1F3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D1F3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D1F3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D1F3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms