Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F1

Ndc80, Kinetochore protein NDC80 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc80Q9D0F1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndc80Q9D0F1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndc80Q9D0F1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndc80Q9D0F1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndc80Q9D0F1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ndc80Q9D0F1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndc80Q9D0F1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndc80Q9D0F1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndc80Q9D0F1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndc80Q9D0F1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndc80Q9D0F1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndc80Q9D0F1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndc80Q9D0F1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndc80Q9D0F1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndc80Q9D0F1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndc80Q9D0F1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndc80Q9D0F1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndc80Q9D0F1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndc80Q9D0F1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndc80Q9D0F1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndc80Q9D0F1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndc80Q9D0F1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndc80Q9D0F1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndc80Q9D0F1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndc80Q9D0F1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndc80Q9D0F1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndc80Q9D0F1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndc80Q9D0F1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndc80Q9D0F1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndc80Q9D0F1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndc80Q9D0F1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndc80Q9D0F1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndc80Q9D0F1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndc80Q9D0F1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndc80Q9D0F1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndc80Q9D0F1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndc80Q9D0F1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndc80Q9D0F1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndc80Q9D0F1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndc80Q9D0F1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndc80Q9D0F1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ndc80Q9D0F1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ndc80Q9D0F1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ndc80Q9D0F1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ndc80Q9D0F1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ndc80Q9D0F1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndc80Q9D0F1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndc80Q9D0F1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndc80Q9D0F1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndc80Q9D0F1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndc80Q9D0F1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndc80Q9D0F1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndc80Q9D0F1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndc80Q9D0F1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndc80Q9D0F1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndc80Q9D0F1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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