Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mms19Q9D071 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mms19Q9D071 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mms19Q9D071 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mms19Q9D071 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Mms19Q9D071 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mms19Q9D071 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mms19Q9D071 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Mms19Q9D071 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mms19Q9D071 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mms19Q9D071 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mms19Q9D071 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mms19Q9D071 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mms19Q9D071 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mms19Q9D071 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mms19Q9D071 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mms19Q9D071 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mms19Q9D071 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mms19Q9D071 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mms19Q9D071 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mms19Q9D071 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mms19Q9D071 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Mms19Q9D071 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mms19Q9D071 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mms19Q9D071 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mms19Q9D071 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mms19Q9D071 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mms19Q9D071 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mms19Q9D071 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mms19Q9D071 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mms19Q9D071 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mms19Q9D071 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mms19Q9D071 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mms19Q9D071 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mms19Q9D071 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mms19Q9D071 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mms19Q9D071 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mms19Q9D071 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mms19Q9D071 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mms19Q9D071 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mms19Q9D071 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Mms19Q9D071 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mms19Q9D071 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mms19Q9D071 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mms19Q9D071 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mms19Q9D071 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mms19Q9D071 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mms19Q9D071 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mms19Q9D071 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mms19Q9D071 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mms19Q9D071 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mms19Q9D071 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mms19Q9D071 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mms19Q9D071 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mms19Q9D071 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mms19Q9D071 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mms19Q9D071 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mms19Q9D071 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Mms19Q9D071 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mms19Q9D071 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mms19Q9D071 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Mms19Q9D071 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mms19Q9D071 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mms19Q9D071 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mms19Q9D071 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mms19Q9D071 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mms19Q9D071 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mms19Q9D071 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mms19Q9D071 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mms19Q9D071 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mms19Q9D071 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mms19Q9D071 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mms19Q9D071 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mms19Q9D071 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mms19Q9D071 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Mms19Q9D071 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mms19Q9D071 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mms19Q9D071 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mms19Q9D071 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mms19Q9D071 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mms19Q9D071 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mms19Q9D071 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mms19Q9D071 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mms19Q9D071 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mms19Q9D071 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mms19Q9D071 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mms19Q9D071 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mms19Q9D071 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mms19Q9D071 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mms19Q9D071 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mms19Q9D071 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mms19Q9D071 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mms19Q9D071 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mms19Q9D071 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mms19Q9D071 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mms19Q9D071 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mms19Q9D071 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mms19Q9D071 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mms19Q9D071 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160 ms