Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdhd3Q9CYW4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdhd3Q9CYW4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdhd3Q9CYW4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdhd3Q9CYW4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdhd3Q9CYW4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdhd3Q9CYW4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdhd3Q9CYW4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdhd3Q9CYW4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdhd3Q9CYW4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdhd3Q9CYW4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdhd3Q9CYW4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdhd3Q9CYW4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdhd3Q9CYW4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdhd3Q9CYW4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdhd3Q9CYW4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdhd3Q9CYW4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdhd3Q9CYW4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hdhd3Q9CYW4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hdhd3Q9CYW4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdhd3Q9CYW4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdhd3Q9CYW4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdhd3Q9CYW4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdhd3Q9CYW4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdhd3Q9CYW4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdhd3Q9CYW4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdhd3Q9CYW4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdhd3Q9CYW4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdhd3Q9CYW4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdhd3Q9CYW4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdhd3Q9CYW4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdhd3Q9CYW4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdhd3Q9CYW4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdhd3Q9CYW4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdhd3Q9CYW4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdhd3Q9CYW4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdhd3Q9CYW4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdhd3Q9CYW4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdhd3Q9CYW4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdhd3Q9CYW4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdhd3Q9CYW4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdhd3Q9CYW4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdhd3Q9CYW4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdhd3Q9CYW4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdhd3Q9CYW4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdhd3Q9CYW4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdhd3Q9CYW4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdhd3Q9CYW4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hdhd3Q9CYW4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms