Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zcchc8Q9CYA6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zcchc8Q9CYA6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zcchc8Q9CYA6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zcchc8Q9CYA6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zcchc8Q9CYA6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zcchc8Q9CYA6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zcchc8Q9CYA6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zcchc8Q9CYA6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zcchc8Q9CYA6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zcchc8Q9CYA6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zcchc8Q9CYA6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zcchc8Q9CYA6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Zcchc8Q9CYA6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zcchc8Q9CYA6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Zcchc8Q9CYA6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zcchc8Q9CYA6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zcchc8Q9CYA6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zcchc8Q9CYA6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zcchc8Q9CYA6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zcchc8Q9CYA6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zcchc8Q9CYA6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zcchc8Q9CYA6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zcchc8Q9CYA6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zcchc8Q9CYA6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zcchc8Q9CYA6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zcchc8Q9CYA6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zcchc8Q9CYA6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zcchc8Q9CYA6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zcchc8Q9CYA6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zcchc8Q9CYA6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zcchc8Q9CYA6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zcchc8Q9CYA6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zcchc8Q9CYA6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zcchc8Q9CYA6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zcchc8Q9CYA6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zcchc8Q9CYA6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zcchc8Q9CYA6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zcchc8Q9CYA6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Zcchc8Q9CYA6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zcchc8Q9CYA6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zcchc8Q9CYA6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zcchc8Q9CYA6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zcchc8Q9CYA6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zcchc8Q9CYA6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zcchc8Q9CYA6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zcchc8Q9CYA6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Zcchc8Q9CYA6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zcchc8Q9CYA6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zcchc8Q9CYA6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zcchc8Q9CYA6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zcchc8Q9CYA6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zcchc8Q9CYA6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Zcchc8Q9CYA6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zcchc8Q9CYA6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zcchc8Q9CYA6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Zcchc8Q9CYA6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms