Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ChtopQ9CY57 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChtopQ9CY57 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChtopQ9CY57 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChtopQ9CY57 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChtopQ9CY57 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChtopQ9CY57 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChtopQ9CY57 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChtopQ9CY57 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChtopQ9CY57 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChtopQ9CY57 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChtopQ9CY57 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChtopQ9CY57 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChtopQ9CY57 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChtopQ9CY57 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChtopQ9CY57 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChtopQ9CY57 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChtopQ9CY57 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChtopQ9CY57 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ChtopQ9CY57 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChtopQ9CY57 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChtopQ9CY57 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChtopQ9CY57 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChtopQ9CY57 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChtopQ9CY57 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChtopQ9CY57 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChtopQ9CY57 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChtopQ9CY57 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChtopQ9CY57 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChtopQ9CY57 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChtopQ9CY57 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChtopQ9CY57 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChtopQ9CY57 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChtopQ9CY57 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChtopQ9CY57 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChtopQ9CY57 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChtopQ9CY57 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChtopQ9CY57 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChtopQ9CY57 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChtopQ9CY57 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChtopQ9CY57 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChtopQ9CY57 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChtopQ9CY57 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChtopQ9CY57 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChtopQ9CY57 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChtopQ9CY57 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChtopQ9CY57 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChtopQ9CY57 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChtopQ9CY57 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ChtopQ9CY57 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChtopQ9CY57 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChtopQ9CY57 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChtopQ9CY57 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChtopQ9CY57 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChtopQ9CY57 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChtopQ9CY57 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChtopQ9CY57 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChtopQ9CY57 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChtopQ9CY57 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChtopQ9CY57 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChtopQ9CY57 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChtopQ9CY57 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChtopQ9CY57 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChtopQ9CY57 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChtopQ9CY57 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChtopQ9CY57 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChtopQ9CY57 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ChtopQ9CY57 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChtopQ9CY57 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChtopQ9CY57 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ChtopQ9CY57 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChtopQ9CY57 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChtopQ9CY57 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChtopQ9CY57 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChtopQ9CY57 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChtopQ9CY57 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ChtopQ9CY57 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms