Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXB8

Alpk1, Alpha-protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk1Q9CXB8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Alpk1Q9CXB8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Alpk1Q9CXB8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Alpk1Q9CXB8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Alpk1Q9CXB8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Alpk1Q9CXB8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Alpk1Q9CXB8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Alpk1Q9CXB8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Alpk1Q9CXB8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Alpk1Q9CXB8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Alpk1Q9CXB8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Alpk1Q9CXB8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Alpk1Q9CXB8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Alpk1Q9CXB8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Alpk1Q9CXB8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Alpk1Q9CXB8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Alpk1Q9CXB8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Alpk1Q9CXB8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Alpk1Q9CXB8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Alpk1Q9CXB8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Alpk1Q9CXB8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Alpk1Q9CXB8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Alpk1Q9CXB8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Alpk1Q9CXB8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Alpk1Q9CXB8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Alpk1Q9CXB8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Alpk1Q9CXB8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Alpk1Q9CXB8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Alpk1Q9CXB8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Alpk1Q9CXB8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Alpk1Q9CXB8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Alpk1Q9CXB8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Alpk1Q9CXB8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Alpk1Q9CXB8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Alpk1Q9CXB8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Alpk1Q9CXB8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Alpk1Q9CXB8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Alpk1Q9CXB8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Alpk1Q9CXB8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Alpk1Q9CXB8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Alpk1Q9CXB8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Alpk1Q9CXB8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Alpk1Q9CXB8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Alpk1Q9CXB8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Alpk1Q9CXB8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Alpk1Q9CXB8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Alpk1Q9CXB8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Alpk1Q9CXB8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Alpk1Q9CXB8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Alpk1Q9CXB8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Alpk1Q9CXB8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Alpk1Q9CXB8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Alpk1Q9CXB8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Alpk1Q9CXB8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Alpk1Q9CXB8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Alpk1Q9CXB8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Alpk1Q9CXB8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Alpk1Q9CXB8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Alpk1Q9CXB8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Alpk1Q9CXB8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Alpk1Q9CXB8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Alpk1Q9CXB8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Alpk1Q9CXB8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Alpk1Q9CXB8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Alpk1Q9CXB8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Alpk1Q9CXB8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Alpk1Q9CXB8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Alpk1Q9CXB8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Alpk1Q9CXB8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Alpk1Q9CXB8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Alpk1Q9CXB8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Alpk1Q9CXB8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Alpk1Q9CXB8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Alpk1Q9CXB8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Alpk1Q9CXB8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Alpk1Q9CXB8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Alpk1Q9CXB8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Alpk1Q9CXB8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Alpk1Q9CXB8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Alpk1Q9CXB8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Alpk1Q9CXB8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Alpk1Q9CXB8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Alpk1Q9CXB8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Alpk1Q9CXB8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Alpk1Q9CXB8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Alpk1Q9CXB8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Alpk1Q9CXB8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Alpk1Q9CXB8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Alpk1Q9CXB8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Alpk1Q9CXB8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Alpk1Q9CXB8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Alpk1Q9CXB8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Alpk1Q9CXB8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Alpk1Q9CXB8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Alpk1Q9CXB8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Alpk1Q9CXB8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Alpk1Q9CXB8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Alpk1Q9CXB8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Alpk1Q9CXB8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Alpk1Q9CXB8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms