Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700029F12RikQ9CRB4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700029F12RikQ9CRB4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700029F12RikQ9CRB4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700029F12RikQ9CRB4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
1700029F12RikQ9CRB4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700029F12RikQ9CRB4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700029F12RikQ9CRB4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700029F12RikQ9CRB4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
1700029F12RikQ9CRB4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700029F12RikQ9CRB4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms