Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc43Q9CR29 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc43Q9CR29 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc43Q9CR29 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc43Q9CR29 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc43Q9CR29 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc43Q9CR29 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc43Q9CR29 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc43Q9CR29 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc43Q9CR29 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc43Q9CR29 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc43Q9CR29 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc43Q9CR29 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc43Q9CR29 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc43Q9CR29 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc43Q9CR29 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc43Q9CR29 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc43Q9CR29 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc43Q9CR29 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc43Q9CR29 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc43Q9CR29 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc43Q9CR29 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc43Q9CR29 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc43Q9CR29 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc43Q9CR29 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc43Q9CR29 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc43Q9CR29 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc43Q9CR29 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc43Q9CR29 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc43Q9CR29 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc43Q9CR29 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc43Q9CR29 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc43Q9CR29 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc43Q9CR29 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc43Q9CR29 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc43Q9CR29 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc43Q9CR29 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc43Q9CR29 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc43Q9CR29 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc43Q9CR29 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc43Q9CR29 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc43Q9CR29 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc43Q9CR29 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc43Q9CR29 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc43Q9CR29 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc43Q9CR29 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc43Q9CR29 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc43Q9CR29 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc43Q9CR29 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc43Q9CR29 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc43Q9CR29 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc43Q9CR29 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc43Q9CR29 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc43Q9CR29 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc43Q9CR29 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc43Q9CR29 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc43Q9CR29 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc43Q9CR29 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc43Q9CR29 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc43Q9CR29 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc43Q9CR29 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc43Q9CR29 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc43Q9CR29 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc43Q9CR29 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc43Q9CR29 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc43Q9CR29 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc43Q9CR29 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc43Q9CR29 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc43Q9CR29 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc43Q9CR29 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc43Q9CR29 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc43Q9CR29 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc43Q9CR29 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc43Q9CR29 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc43Q9CR29 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc43Q9CR29 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc43Q9CR29 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc43Q9CR29 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc43Q9CR29 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc43Q9CR29 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc43Q9CR29 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151 ms