Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atg12Q9CQY1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms