Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQV1

Pam16, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM16, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pam16Q9CQV1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pam16Q9CQV1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pam16Q9CQV1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pam16Q9CQV1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pam16Q9CQV1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pam16Q9CQV1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pam16Q9CQV1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pam16Q9CQV1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pam16Q9CQV1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pam16Q9CQV1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pam16Q9CQV1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pam16Q9CQV1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pam16Q9CQV1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pam16Q9CQV1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pam16Q9CQV1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pam16Q9CQV1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pam16Q9CQV1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pam16Q9CQV1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pam16Q9CQV1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pam16Q9CQV1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pam16Q9CQV1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pam16Q9CQV1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pam16Q9CQV1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pam16Q9CQV1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pam16Q9CQV1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pam16Q9CQV1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pam16Q9CQV1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pam16Q9CQV1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pam16Q9CQV1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pam16Q9CQV1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pam16Q9CQV1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pam16Q9CQV1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pam16Q9CQV1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pam16Q9CQV1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pam16Q9CQV1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pam16Q9CQV1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pam16Q9CQV1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pam16Q9CQV1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pam16Q9CQV1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pam16Q9CQV1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms