Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rwdd1Q9CQK7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rwdd1Q9CQK7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rwdd1Q9CQK7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rwdd1Q9CQK7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rwdd1Q9CQK7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rwdd1Q9CQK7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rwdd1Q9CQK7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rwdd1Q9CQK7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rwdd1Q9CQK7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rwdd1Q9CQK7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rwdd1Q9CQK7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rwdd1Q9CQK7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rwdd1Q9CQK7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rwdd1Q9CQK7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rwdd1Q9CQK7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rwdd1Q9CQK7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rwdd1Q9CQK7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rwdd1Q9CQK7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rwdd1Q9CQK7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Rwdd1Q9CQK7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rwdd1Q9CQK7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rwdd1Q9CQK7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rwdd1Q9CQK7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rwdd1Q9CQK7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rwdd1Q9CQK7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rwdd1Q9CQK7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rwdd1Q9CQK7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rwdd1Q9CQK7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rwdd1Q9CQK7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rwdd1Q9CQK7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rwdd1Q9CQK7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rwdd1Q9CQK7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rwdd1Q9CQK7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rwdd1Q9CQK7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rwdd1Q9CQK7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rwdd1Q9CQK7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Rwdd1Q9CQK7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rwdd1Q9CQK7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rwdd1Q9CQK7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rwdd1Q9CQK7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rwdd1Q9CQK7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rwdd1Q9CQK7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rwdd1Q9CQK7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rwdd1Q9CQK7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rwdd1Q9CQK7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rwdd1Q9CQK7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rwdd1Q9CQK7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rwdd1Q9CQK7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rwdd1Q9CQK7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rwdd1Q9CQK7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rwdd1Q9CQK7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rwdd1Q9CQK7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rwdd1Q9CQK7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rwdd1Q9CQK7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rwdd1Q9CQK7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rwdd1Q9CQK7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rwdd1Q9CQK7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rwdd1Q9CQK7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rwdd1Q9CQK7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rwdd1Q9CQK7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Rwdd1Q9CQK7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rwdd1Q9CQK7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Rwdd1Q9CQK7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rwdd1Q9CQK7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rwdd1Q9CQK7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rwdd1Q9CQK7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rwdd1Q9CQK7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rwdd1Q9CQK7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rwdd1Q9CQK7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rwdd1Q9CQK7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rwdd1Q9CQK7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rwdd1Q9CQK7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rwdd1Q9CQK7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Rwdd1Q9CQK7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Rwdd1Q9CQK7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Rwdd1Q9CQK7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rwdd1Q9CQK7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Rwdd1Q9CQK7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rwdd1Q9CQK7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rwdd1Q9CQK7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rwdd1Q9CQK7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rwdd1Q9CQK7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rwdd1Q9CQK7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rwdd1Q9CQK7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rwdd1Q9CQK7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rwdd1Q9CQK7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rwdd1Q9CQK7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rwdd1Q9CQK7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Rwdd1Q9CQK7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Rwdd1Q9CQK7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rwdd1Q9CQK7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rwdd1Q9CQK7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rwdd1Q9CQK7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rwdd1Q9CQK7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rwdd1Q9CQK7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rwdd1Q9CQK7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rwdd1Q9CQK7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rwdd1Q9CQK7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rwdd1Q9CQK7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms