Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTRAFQ9CQE8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTRAFQ9CQE8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RTRAFQ9CQE8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTRAFQ9CQE8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms