Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkp2Q9CQ73 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pkp2Q9CQ73 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pkp2Q9CQ73 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pkp2Q9CQ73 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pkp2Q9CQ73 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pkp2Q9CQ73 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pkp2Q9CQ73 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pkp2Q9CQ73 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pkp2Q9CQ73 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pkp2Q9CQ73 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pkp2Q9CQ73 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pkp2Q9CQ73 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pkp2Q9CQ73 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkp2Q9CQ73 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkp2Q9CQ73 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkp2Q9CQ73 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkp2Q9CQ73 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkp2Q9CQ73 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkp2Q9CQ73 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkp2Q9CQ73 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkp2Q9CQ73 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkp2Q9CQ73 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkp2Q9CQ73 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkp2Q9CQ73 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkp2Q9CQ73 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkp2Q9CQ73 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkp2Q9CQ73 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkp2Q9CQ73 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkp2Q9CQ73 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkp2Q9CQ73 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkp2Q9CQ73 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkp2Q9CQ73 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkp2Q9CQ73 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkp2Q9CQ73 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkp2Q9CQ73 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkp2Q9CQ73 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkp2Q9CQ73 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkp2Q9CQ73 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkp2Q9CQ73 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkp2Q9CQ73 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkp2Q9CQ73 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkp2Q9CQ73 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkp2Q9CQ73 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkp2Q9CQ73 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkp2Q9CQ73 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pkp2Q9CQ73 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkp2Q9CQ73 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkp2Q9CQ73 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkp2Q9CQ73 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkp2Q9CQ73 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkp2Q9CQ73 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkp2Q9CQ73 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkp2Q9CQ73 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkp2Q9CQ73 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkp2Q9CQ73 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkp2Q9CQ73 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkp2Q9CQ73 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkp2Q9CQ73 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pkp2Q9CQ73 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pkp2Q9CQ73 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pkp2Q9CQ73 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkp2Q9CQ73 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkp2Q9CQ73 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkp2Q9CQ73 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkp2Q9CQ73 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkp2Q9CQ73 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkp2Q9CQ73 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkp2Q9CQ73 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkp2Q9CQ73 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkp2Q9CQ73 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkp2Q9CQ73 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkp2Q9CQ73 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkp2Q9CQ73 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkp2Q9CQ73 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkp2Q9CQ73 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkp2Q9CQ73 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkp2Q9CQ73 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkp2Q9CQ73 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkp2Q9CQ73 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkp2Q9CQ73 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkp2Q9CQ73 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pkp2Q9CQ73 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pkp2Q9CQ73 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pkp2Q9CQ73 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pkp2Q9CQ73 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pkp2Q9CQ73 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pkp2Q9CQ73 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pkp2Q9CQ73 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pkp2Q9CQ73 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pkp2Q9CQ73 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pkp2Q9CQ73 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pkp2Q9CQ73 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pkp2Q9CQ73 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pkp2Q9CQ73 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pkp2Q9CQ73 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pkp2Q9CQ73 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pkp2Q9CQ73 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pkp2Q9CQ73 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pkp2Q9CQ73 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms