Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPW0

Cntnap2, Contactin-associated protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap2Q9CPW0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cntnap2Q9CPW0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cntnap2Q9CPW0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cntnap2Q9CPW0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cntnap2Q9CPW0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cntnap2Q9CPW0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cntnap2Q9CPW0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cntnap2Q9CPW0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cntnap2Q9CPW0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cntnap2Q9CPW0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cntnap2Q9CPW0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cntnap2Q9CPW0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cntnap2Q9CPW0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cntnap2Q9CPW0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cntnap2Q9CPW0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cntnap2Q9CPW0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cntnap2Q9CPW0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cntnap2Q9CPW0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cntnap2Q9CPW0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cntnap2Q9CPW0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cntnap2Q9CPW0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cntnap2Q9CPW0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cntnap2Q9CPW0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cntnap2Q9CPW0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cntnap2Q9CPW0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cntnap2Q9CPW0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cntnap2Q9CPW0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cntnap2Q9CPW0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cntnap2Q9CPW0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cntnap2Q9CPW0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cntnap2Q9CPW0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cntnap2Q9CPW0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cntnap2Q9CPW0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cntnap2Q9CPW0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cntnap2Q9CPW0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cntnap2Q9CPW0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cntnap2Q9CPW0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cntnap2Q9CPW0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cntnap2Q9CPW0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cntnap2Q9CPW0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Cntnap2Q9CPW0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cntnap2Q9CPW0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cntnap2Q9CPW0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cntnap2Q9CPW0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cntnap2Q9CPW0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cntnap2Q9CPW0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cntnap2Q9CPW0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cntnap2Q9CPW0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cntnap2Q9CPW0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cntnap2Q9CPW0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cntnap2Q9CPW0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cntnap2Q9CPW0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cntnap2Q9CPW0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cntnap2Q9CPW0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cntnap2Q9CPW0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cntnap2Q9CPW0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cntnap2Q9CPW0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cntnap2Q9CPW0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cntnap2Q9CPW0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cntnap2Q9CPW0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cntnap2Q9CPW0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cntnap2Q9CPW0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cntnap2Q9CPW0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cntnap2Q9CPW0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cntnap2Q9CPW0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cntnap2Q9CPW0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cntnap2Q9CPW0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cntnap2Q9CPW0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cntnap2Q9CPW0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cntnap2Q9CPW0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cntnap2Q9CPW0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cntnap2Q9CPW0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cntnap2Q9CPW0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cntnap2Q9CPW0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cntnap2Q9CPW0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cntnap2Q9CPW0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cntnap2Q9CPW0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cntnap2Q9CPW0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cntnap2Q9CPW0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cntnap2Q9CPW0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cntnap2Q9CPW0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cntnap2Q9CPW0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cntnap2Q9CPW0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cntnap2Q9CPW0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cntnap2Q9CPW0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cntnap2Q9CPW0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cntnap2Q9CPW0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cntnap2Q9CPW0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cntnap2Q9CPW0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cntnap2Q9CPW0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cntnap2Q9CPW0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cntnap2Q9CPW0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cntnap2Q9CPW0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cntnap2Q9CPW0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cntnap2Q9CPW0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cntnap2Q9CPW0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cntnap2Q9CPW0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cntnap2Q9CPW0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cntnap2Q9CPW0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cntnap2Q9CPW0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms