Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM15Q9C019 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms