Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CELF4Q9BZC1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CELF4Q9BZC1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CELF4Q9BZC1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CELF4Q9BZC1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CELF4Q9BZC1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CELF4Q9BZC1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CELF4Q9BZC1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CELF4Q9BZC1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CELF4Q9BZC1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CELF4Q9BZC1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CELF4Q9BZC1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CELF4Q9BZC1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CELF4Q9BZC1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CELF4Q9BZC1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CELF4Q9BZC1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CELF4Q9BZC1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CELF4Q9BZC1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CELF4Q9BZC1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CELF4Q9BZC1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CELF4Q9BZC1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CELF4Q9BZC1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CELF4Q9BZC1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CELF4Q9BZC1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CELF4Q9BZC1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CELF4Q9BZC1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CELF4Q9BZC1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CELF4Q9BZC1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CELF4Q9BZC1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CELF4Q9BZC1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CELF4Q9BZC1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CELF4Q9BZC1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CELF4Q9BZC1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CELF4Q9BZC1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CELF4Q9BZC1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CELF4Q9BZC1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CELF4Q9BZC1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CELF4Q9BZC1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CELF4Q9BZC1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CELF4Q9BZC1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CELF4Q9BZC1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CELF4Q9BZC1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CELF4Q9BZC1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CELF4Q9BZC1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CELF4Q9BZC1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CELF4Q9BZC1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CELF4Q9BZC1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CELF4Q9BZC1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CELF4Q9BZC1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CELF4Q9BZC1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CELF4Q9BZC1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CELF4Q9BZC1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CELF4Q9BZC1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CELF4Q9BZC1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CELF4Q9BZC1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CELF4Q9BZC1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CELF4Q9BZC1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CELF4Q9BZC1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms