Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD1

MRPL13, 39S ribosomal protein L13, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL13Q9BYD1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MRPL13Q9BYD1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRPL13Q9BYD1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRPL13Q9BYD1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL13Q9BYD1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL13Q9BYD1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL13Q9BYD1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL13Q9BYD1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL13Q9BYD1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL13Q9BYD1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL13Q9BYD1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL13Q9BYD1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL13Q9BYD1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL13Q9BYD1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL13Q9BYD1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL13Q9BYD1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL13Q9BYD1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL13Q9BYD1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL13Q9BYD1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL13Q9BYD1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL13Q9BYD1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL13Q9BYD1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL13Q9BYD1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL13Q9BYD1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL13Q9BYD1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL13Q9BYD1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL13Q9BYD1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL13Q9BYD1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL13Q9BYD1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL13Q9BYD1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL13Q9BYD1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL13Q9BYD1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL13Q9BYD1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL13Q9BYD1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL13Q9BYD1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL13Q9BYD1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL13Q9BYD1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL13Q9BYD1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL13Q9BYD1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL13Q9BYD1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL13Q9BYD1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL13Q9BYD1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL13Q9BYD1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL13Q9BYD1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL13Q9BYD1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL13Q9BYD1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL13Q9BYD1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL13Q9BYD1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL13Q9BYD1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL13Q9BYD1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL13Q9BYD1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL13Q9BYD1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL13Q9BYD1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL13Q9BYD1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL13Q9BYD1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL13Q9BYD1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRPL13Q9BYD1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL13Q9BYD1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms