Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
SCAPERQ9BY12 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SCAPERQ9BY12 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SCAPERQ9BY12 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
SCAPERQ9BY12 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
SCAPERQ9BY12 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
SCAPERQ9BY12 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
SCAPERQ9BY12 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
SCAPERQ9BY12 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SCAPERQ9BY12 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SCAPERQ9BY12 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SCAPERQ9BY12 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SCAPERQ9BY12 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SCAPERQ9BY12 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
SCAPERQ9BY12 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
SCAPERQ9BY12 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
SCAPERQ9BY12 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
SCAPERQ9BY12 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
SCAPERQ9BY12 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC37.17■■■■□ 3.54
SCAPERQ9BY12 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
SCAPERQ9BY12 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
SCAPERQ9BY12 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
SCAPERQ9BY12 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SCAPERQ9BY12 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
SCAPERQ9BY12 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SCAPERQ9BY12 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
SCAPERQ9BY12 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
SCAPERQ9BY12 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SCAPERQ9BY12 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
SCAPERQ9BY12 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.54
SCAPERQ9BY12 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
SCAPERQ9BY12 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
SCAPERQ9BY12 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SCAPERQ9BY12 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SCAPERQ9BY12 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SCAPERQ9BY12 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SCAPERQ9BY12 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
SCAPERQ9BY12 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SCAPERQ9BY12 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SCAPERQ9BY12 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SCAPERQ9BY12 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
SCAPERQ9BY12 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
SCAPERQ9BY12 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
SCAPERQ9BY12 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
SCAPERQ9BY12 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
SCAPERQ9BY12 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
SCAPERQ9BY12 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
SCAPERQ9BY12 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
SCAPERQ9BY12 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
SCAPERQ9BY12 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
SCAPERQ9BY12 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
SCAPERQ9BY12 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SCAPERQ9BY12 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SCAPERQ9BY12 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
SCAPERQ9BY12 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC37.07■■■■□ 3.52
SCAPERQ9BY12 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
SCAPERQ9BY12 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SCAPERQ9BY12 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SCAPERQ9BY12 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SCAPERQ9BY12 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SCAPERQ9BY12 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SCAPERQ9BY12 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SCAPERQ9BY12 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SCAPERQ9BY12 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
SCAPERQ9BY12 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SCAPERQ9BY12 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SCAPERQ9BY12 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SCAPERQ9BY12 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SCAPERQ9BY12 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SCAPERQ9BY12 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SCAPERQ9BY12 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SCAPERQ9BY12 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
SCAPERQ9BY12 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SCAPERQ9BY12 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
SCAPERQ9BY12 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
SCAPERQ9BY12 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
SCAPERQ9BY12 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SCAPERQ9BY12 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
SCAPERQ9BY12 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
SCAPERQ9BY12 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
SCAPERQ9BY12 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC36.99■■■■□ 3.51
SCAPERQ9BY12 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SCAPERQ9BY12 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SCAPERQ9BY12 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
SCAPERQ9BY12 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SCAPERQ9BY12 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
SCAPERQ9BY12 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SCAPERQ9BY12 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC36.97■■■■□ 3.51
SCAPERQ9BY12 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
SCAPERQ9BY12 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
SCAPERQ9BY12 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
SCAPERQ9BY12 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SCAPERQ9BY12 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SCAPERQ9BY12 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SCAPERQ9BY12 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
SCAPERQ9BY12 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
SCAPERQ9BY12 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
SCAPERQ9BY12 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC36.95■■■■□ 3.51
SCAPERQ9BY12 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC36.95■■■■□ 3.51
SCAPERQ9BY12 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms