Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP4Q9BWG4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP4Q9BWG4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms