Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV90

SNRNP25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25Q9BV90 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRNP25Q9BV90 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRNP25Q9BV90 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRNP25Q9BV90 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRNP25Q9BV90 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRNP25Q9BV90 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRNP25Q9BV90 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRNP25Q9BV90 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRNP25Q9BV90 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRNP25Q9BV90 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRNP25Q9BV90 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRNP25Q9BV90 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRNP25Q9BV90 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRNP25Q9BV90 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRNP25Q9BV90 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRNP25Q9BV90 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRNP25Q9BV90 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRNP25Q9BV90 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRNP25Q9BV90 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRNP25Q9BV90 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRNP25Q9BV90 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRNP25Q9BV90 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRNP25Q9BV90 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNRNP25Q9BV90 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNRNP25Q9BV90 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SNRNP25Q9BV90 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNRNP25Q9BV90 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SNRNP25Q9BV90 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNRNP25Q9BV90 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNRNP25Q9BV90 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNRNP25Q9BV90 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNRNP25Q9BV90 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNRNP25Q9BV90 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNRNP25Q9BV90 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNRNP25Q9BV90 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNRNP25Q9BV90 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNRNP25Q9BV90 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNRNP25Q9BV90 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNRNP25Q9BV90 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNRNP25Q9BV90 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNRNP25Q9BV90 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNRNP25Q9BV90 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNRNP25Q9BV90 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNRNP25Q9BV90 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SNRNP25Q9BV90 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNRNP25Q9BV90 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNRNP25Q9BV90 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNRNP25Q9BV90 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRNP25Q9BV90 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRNP25Q9BV90 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRNP25Q9BV90 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRNP25Q9BV90 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRNP25Q9BV90 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNRNP25Q9BV90 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNRNP25Q9BV90 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNRNP25Q9BV90 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNRNP25Q9BV90 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNRNP25Q9BV90 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNRNP25Q9BV90 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNRNP25Q9BV90 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNRNP25Q9BV90 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNRNP25Q9BV90 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNRNP25Q9BV90 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNRNP25Q9BV90 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRNP25Q9BV90 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRNP25Q9BV90 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms