Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TIMM29Q9BSF4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TIMM29Q9BSF4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TIMM29Q9BSF4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TIMM29Q9BSF4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TIMM29Q9BSF4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TIMM29Q9BSF4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TIMM29Q9BSF4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TIMM29Q9BSF4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TIMM29Q9BSF4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TIMM29Q9BSF4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TIMM29Q9BSF4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TIMM29Q9BSF4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TIMM29Q9BSF4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TIMM29Q9BSF4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TIMM29Q9BSF4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TIMM29Q9BSF4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TIMM29Q9BSF4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TIMM29Q9BSF4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TIMM29Q9BSF4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TIMM29Q9BSF4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TIMM29Q9BSF4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TIMM29Q9BSF4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TIMM29Q9BSF4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TIMM29Q9BSF4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TIMM29Q9BSF4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TIMM29Q9BSF4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.9 ms