Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ATG101Q9BSB4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG101Q9BSB4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG101Q9BSB4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG101Q9BSB4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG101Q9BSB4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.6 ms