Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PAAF1Q9BRP4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PAAF1Q9BRP4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PAAF1Q9BRP4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PAAF1Q9BRP4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PAAF1Q9BRP4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PAAF1Q9BRP4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAAF1Q9BRP4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAAF1Q9BRP4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAAF1Q9BRP4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAAF1Q9BRP4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAAF1Q9BRP4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAAF1Q9BRP4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAAF1Q9BRP4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAAF1Q9BRP4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAAF1Q9BRP4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAAF1Q9BRP4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAAF1Q9BRP4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PAAF1Q9BRP4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAAF1Q9BRP4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAAF1Q9BRP4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAAF1Q9BRP4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAAF1Q9BRP4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAAF1Q9BRP4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAAF1Q9BRP4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAAF1Q9BRP4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PAAF1Q9BRP4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PAAF1Q9BRP4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PAAF1Q9BRP4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PAAF1Q9BRP4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PAAF1Q9BRP4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PAAF1Q9BRP4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PAAF1Q9BRP4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PAAF1Q9BRP4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PAAF1Q9BRP4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PAAF1Q9BRP4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PAAF1Q9BRP4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PAAF1Q9BRP4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PAAF1Q9BRP4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PAAF1Q9BRP4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PAAF1Q9BRP4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PAAF1Q9BRP4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PAAF1Q9BRP4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PAAF1Q9BRP4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PAAF1Q9BRP4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PAAF1Q9BRP4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PAAF1Q9BRP4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAAF1Q9BRP4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAAF1Q9BRP4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAAF1Q9BRP4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAAF1Q9BRP4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PAAF1Q9BRP4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PAAF1Q9BRP4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PAAF1Q9BRP4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PAAF1Q9BRP4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PAAF1Q9BRP4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PAAF1Q9BRP4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PAAF1Q9BRP4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PAAF1Q9BRP4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PAAF1Q9BRP4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PAAF1Q9BRP4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PAAF1Q9BRP4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAAF1Q9BRP4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAAF1Q9BRP4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAAF1Q9BRP4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAAF1Q9BRP4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAAF1Q9BRP4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAAF1Q9BRP4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAAF1Q9BRP4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAAF1Q9BRP4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAAF1Q9BRP4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAAF1Q9BRP4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAAF1Q9BRP4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAAF1Q9BRP4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAAF1Q9BRP4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAAF1Q9BRP4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAAF1Q9BRP4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAAF1Q9BRP4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PAAF1Q9BRP4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAAF1Q9BRP4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAAF1Q9BRP4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAAF1Q9BRP4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PAAF1Q9BRP4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAAF1Q9BRP4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PAAF1Q9BRP4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAAF1Q9BRP4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAAF1Q9BRP4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAAF1Q9BRP4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PAAF1Q9BRP4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PAAF1Q9BRP4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PAAF1Q9BRP4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PAAF1Q9BRP4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PAAF1Q9BRP4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PAAF1Q9BRP4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PAAF1Q9BRP4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PAAF1Q9BRP4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PAAF1Q9BRP4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PAAF1Q9BRP4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PAAF1Q9BRP4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PAAF1Q9BRP4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms