Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCK3Q9BQ16 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCK3Q9BQ16 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCK3Q9BQ16 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCK3Q9BQ16 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCK3Q9BQ16 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCK3Q9BQ16 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCK3Q9BQ16 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCK3Q9BQ16 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCK3Q9BQ16 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCK3Q9BQ16 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCK3Q9BQ16 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCK3Q9BQ16 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPOCK3Q9BQ16 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPOCK3Q9BQ16 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPOCK3Q9BQ16 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SPOCK3Q9BQ16 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPOCK3Q9BQ16 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPOCK3Q9BQ16 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPOCK3Q9BQ16 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPOCK3Q9BQ16 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPOCK3Q9BQ16 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPOCK3Q9BQ16 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPOCK3Q9BQ16 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPOCK3Q9BQ16 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPOCK3Q9BQ16 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPOCK3Q9BQ16 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPOCK3Q9BQ16 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPOCK3Q9BQ16 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPOCK3Q9BQ16 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPOCK3Q9BQ16 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPOCK3Q9BQ16 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPOCK3Q9BQ16 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPOCK3Q9BQ16 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPOCK3Q9BQ16 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPOCK3Q9BQ16 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPOCK3Q9BQ16 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPOCK3Q9BQ16 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPOCK3Q9BQ16 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPOCK3Q9BQ16 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPOCK3Q9BQ16 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPOCK3Q9BQ16 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPOCK3Q9BQ16 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPOCK3Q9BQ16 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPOCK3Q9BQ16 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPOCK3Q9BQ16 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SPOCK3Q9BQ16 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPOCK3Q9BQ16 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPOCK3Q9BQ16 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPOCK3Q9BQ16 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPOCK3Q9BQ16 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPOCK3Q9BQ16 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPOCK3Q9BQ16 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPOCK3Q9BQ16 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPOCK3Q9BQ16 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPOCK3Q9BQ16 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPOCK3Q9BQ16 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SPOCK3Q9BQ16 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SPOCK3Q9BQ16 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPOCK3Q9BQ16 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPOCK3Q9BQ16 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPOCK3Q9BQ16 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPOCK3Q9BQ16 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPOCK3Q9BQ16 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPOCK3Q9BQ16 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPOCK3Q9BQ16 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPOCK3Q9BQ16 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPOCK3Q9BQ16 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPOCK3Q9BQ16 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPOCK3Q9BQ16 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPOCK3Q9BQ16 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPOCK3Q9BQ16 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPOCK3Q9BQ16 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SPOCK3Q9BQ16 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SPOCK3Q9BQ16 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SPOCK3Q9BQ16 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPOCK3Q9BQ16 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPOCK3Q9BQ16 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPOCK3Q9BQ16 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPOCK3Q9BQ16 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPOCK3Q9BQ16 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPOCK3Q9BQ16 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPOCK3Q9BQ16 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPOCK3Q9BQ16 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SPOCK3Q9BQ16 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
SPOCK3Q9BQ16 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
SPOCK3Q9BQ16 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPOCK3Q9BQ16 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPOCK3Q9BQ16 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPOCK3Q9BQ16 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPOCK3Q9BQ16 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPOCK3Q9BQ16 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPOCK3Q9BQ16 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPOCK3Q9BQ16 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SPOCK3Q9BQ16 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPOCK3Q9BQ16 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SPOCK3Q9BQ16 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPOCK3Q9BQ16 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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