Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bhlhe41Q99PV5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Bhlhe41Q99PV5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Bhlhe41Q99PV5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bhlhe41Q99PV5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bhlhe41Q99PV5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bhlhe41Q99PV5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bhlhe41Q99PV5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bhlhe41Q99PV5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bhlhe41Q99PV5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bhlhe41Q99PV5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bhlhe41Q99PV5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bhlhe41Q99PV5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bhlhe41Q99PV5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bhlhe41Q99PV5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bhlhe41Q99PV5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bhlhe41Q99PV5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bhlhe41Q99PV5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Bhlhe41Q99PV5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bhlhe41Q99PV5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bhlhe41Q99PV5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bhlhe41Q99PV5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bhlhe41Q99PV5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bhlhe41Q99PV5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bhlhe41Q99PV5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bhlhe41Q99PV5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bhlhe41Q99PV5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bhlhe41Q99PV5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bhlhe41Q99PV5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bhlhe41Q99PV5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bhlhe41Q99PV5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bhlhe41Q99PV5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bhlhe41Q99PV5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bhlhe41Q99PV5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bhlhe41Q99PV5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bhlhe41Q99PV5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bhlhe41Q99PV5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bhlhe41Q99PV5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bhlhe41Q99PV5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bhlhe41Q99PV5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Bhlhe41Q99PV5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Bhlhe41Q99PV5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Bhlhe41Q99PV5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bhlhe41Q99PV5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bhlhe41Q99PV5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bhlhe41Q99PV5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bhlhe41Q99PV5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bhlhe41Q99PV5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bhlhe41Q99PV5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bhlhe41Q99PV5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bhlhe41Q99PV5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bhlhe41Q99PV5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bhlhe41Q99PV5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bhlhe41Q99PV5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms