Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab27bQ99P58 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab27bQ99P58 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab27bQ99P58 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab27bQ99P58 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab27bQ99P58 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab27bQ99P58 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab27bQ99P58 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab27bQ99P58 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab27bQ99P58 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab27bQ99P58 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab27bQ99P58 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab27bQ99P58 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab27bQ99P58 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab27bQ99P58 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab27bQ99P58 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab27bQ99P58 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab27bQ99P58 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab27bQ99P58 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab27bQ99P58 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab27bQ99P58 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab27bQ99P58 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab27bQ99P58 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab27bQ99P58 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab27bQ99P58 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab27bQ99P58 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab27bQ99P58 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab27bQ99P58 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab27bQ99P58 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab27bQ99P58 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab27bQ99P58 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab27bQ99P58 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab27bQ99P58 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab27bQ99P58 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab27bQ99P58 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab27bQ99P58 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab27bQ99P58 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab27bQ99P58 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab27bQ99P58 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab27bQ99P58 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab27bQ99P58 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab27bQ99P58 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab27bQ99P58 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab27bQ99P58 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab27bQ99P58 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab27bQ99P58 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab27bQ99P58 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab27bQ99P58 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab27bQ99P58 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Rab27bQ99P58 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab27bQ99P58 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab27bQ99P58 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab27bQ99P58 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab27bQ99P58 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab27bQ99P58 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab27bQ99P58 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab27bQ99P58 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab27bQ99P58 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab27bQ99P58 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab27bQ99P58 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab27bQ99P58 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab27bQ99P58 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab27bQ99P58 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab27bQ99P58 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab27bQ99P58 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab27bQ99P58 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab27bQ99P58 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab27bQ99P58 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab27bQ99P58 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab27bQ99P58 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab27bQ99P58 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab27bQ99P58 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab27bQ99P58 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab27bQ99P58 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab27bQ99P58 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab27bQ99P58 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab27bQ99P58 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab27bQ99P58 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab27bQ99P58 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab27bQ99P58 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab27bQ99P58 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab27bQ99P58 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab27bQ99P58 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab27bQ99P58 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab27bQ99P58 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab27bQ99P58 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab27bQ99P58 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab27bQ99P58 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab27bQ99P58 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab27bQ99P58 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1030.4 ms