Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Pcgf6Q99NA9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Pcgf6Q99NA9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Pcgf6Q99NA9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Pcgf6Q99NA9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Pcgf6Q99NA9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Pcgf6Q99NA9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Pcgf6Q99NA9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Pcgf6Q99NA9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Pcgf6Q99NA9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Pcgf6Q99NA9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Pcgf6Q99NA9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Pcgf6Q99NA9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Pcgf6Q99NA9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Pcgf6Q99NA9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Pcgf6Q99NA9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Pcgf6Q99NA9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Pcgf6Q99NA9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Pcgf6Q99NA9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Pcgf6Q99NA9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Pcgf6Q99NA9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Pcgf6Q99NA9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Pcgf6Q99NA9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Pcgf6Q99NA9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Pcgf6Q99NA9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Pcgf6Q99NA9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Pcgf6Q99NA9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Pcgf6Q99NA9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Pcgf6Q99NA9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Pcgf6Q99NA9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Pcgf6Q99NA9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Pcgf6Q99NA9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Pcgf6Q99NA9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Pcgf6Q99NA9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Pcgf6Q99NA9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Pcgf6Q99NA9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Pcgf6Q99NA9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Pcgf6Q99NA9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Pcgf6Q99NA9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Pcgf6Q99NA9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Pcgf6Q99NA9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Pcgf6Q99NA9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Pcgf6Q99NA9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Pcgf6Q99NA9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Pcgf6Q99NA9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
Pcgf6Q99NA9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
Pcgf6Q99NA9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Pcgf6Q99NA9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Pcgf6Q99NA9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Pcgf6Q99NA9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Pcgf6Q99NA9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Pcgf6Q99NA9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Pcgf6Q99NA9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Pcgf6Q99NA9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Pcgf6Q99NA9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Pcgf6Q99NA9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Pcgf6Q99NA9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Pcgf6Q99NA9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Pcgf6Q99NA9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Pcgf6Q99NA9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Pcgf6Q99NA9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Pcgf6Q99NA9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Pcgf6Q99NA9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Pcgf6Q99NA9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Pcgf6Q99NA9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Pcgf6Q99NA9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Pcgf6Q99NA9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Pcgf6Q99NA9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Pcgf6Q99NA9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Pcgf6Q99NA9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Pcgf6Q99NA9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Pcgf6Q99NA9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Pcgf6Q99NA9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Pcgf6Q99NA9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Pcgf6Q99NA9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Pcgf6Q99NA9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Pcgf6Q99NA9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Pcgf6Q99NA9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Pcgf6Q99NA9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Pcgf6Q99NA9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Pcgf6Q99NA9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Pcgf6Q99NA9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Pcgf6Q99NA9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Pcgf6Q99NA9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Pcgf6Q99NA9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Pcgf6Q99NA9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Pcgf6Q99NA9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Pcgf6Q99NA9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Pcgf6Q99NA9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Pcgf6Q99NA9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Pcgf6Q99NA9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Pcgf6Q99NA9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Pcgf6Q99NA9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Pcgf6Q99NA9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Pcgf6Q99NA9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Pcgf6Q99NA9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Pcgf6Q99NA9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Pcgf6Q99NA9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Pcgf6Q99NA9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Pcgf6Q99NA9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms