Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hdac9Q99N13 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hdac9Q99N13 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hdac9Q99N13 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hdac9Q99N13 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hdac9Q99N13 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hdac9Q99N13 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hdac9Q99N13 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Hdac9Q99N13 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hdac9Q99N13 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hdac9Q99N13 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hdac9Q99N13 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hdac9Q99N13 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hdac9Q99N13 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hdac9Q99N13 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hdac9Q99N13 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hdac9Q99N13 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hdac9Q99N13 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hdac9Q99N13 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hdac9Q99N13 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hdac9Q99N13 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hdac9Q99N13 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hdac9Q99N13 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hdac9Q99N13 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hdac9Q99N13 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hdac9Q99N13 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Hdac9Q99N13 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hdac9Q99N13 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hdac9Q99N13 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hdac9Q99N13 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hdac9Q99N13 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hdac9Q99N13 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hdac9Q99N13 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hdac9Q99N13 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hdac9Q99N13 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hdac9Q99N13 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hdac9Q99N13 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hdac9Q99N13 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hdac9Q99N13 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hdac9Q99N13 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hdac9Q99N13 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hdac9Q99N13 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hdac9Q99N13 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hdac9Q99N13 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hdac9Q99N13 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hdac9Q99N13 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hdac9Q99N13 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hdac9Q99N13 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hdac9Q99N13 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hdac9Q99N13 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hdac9Q99N13 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hdac9Q99N13 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hdac9Q99N13 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hdac9Q99N13 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hdac9Q99N13 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hdac9Q99N13 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Hdac9Q99N13 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hdac9Q99N13 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hdac9Q99N13 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hdac9Q99N13 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hdac9Q99N13 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Hdac9Q99N13 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hdac9Q99N13 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hdac9Q99N13 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hdac9Q99N13 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hdac9Q99N13 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hdac9Q99N13 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hdac9Q99N13 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hdac9Q99N13 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hdac9Q99N13 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hdac9Q99N13 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hdac9Q99N13 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hdac9Q99N13 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hdac9Q99N13 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Hdac9Q99N13 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hdac9Q99N13 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hdac9Q99N13 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hdac9Q99N13 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hdac9Q99N13 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hdac9Q99N13 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hdac9Q99N13 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hdac9Q99N13 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Hdac9Q99N13 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Hdac9Q99N13 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hdac9Q99N13 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hdac9Q99N13 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hdac9Q99N13 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hdac9Q99N13 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hdac9Q99N13 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hdac9Q99N13 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hdac9Q99N13 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Hdac9Q99N13 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hdac9Q99N13 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hdac9Q99N13 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hdac9Q99N13 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hdac9Q99N13 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hdac9Q99N13 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hdac9Q99N13 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hdac9Q99N13 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hdac9Q99N13 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms