Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tdrd1Q99MV1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tdrd1Q99MV1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tdrd1Q99MV1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tdrd1Q99MV1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tdrd1Q99MV1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Tdrd1Q99MV1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tdrd1Q99MV1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tdrd1Q99MV1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tdrd1Q99MV1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tdrd1Q99MV1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tdrd1Q99MV1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tdrd1Q99MV1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tdrd1Q99MV1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tdrd1Q99MV1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tdrd1Q99MV1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tdrd1Q99MV1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tdrd1Q99MV1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tdrd1Q99MV1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tdrd1Q99MV1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tdrd1Q99MV1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tdrd1Q99MV1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Tdrd1Q99MV1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tdrd1Q99MV1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tdrd1Q99MV1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tdrd1Q99MV1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tdrd1Q99MV1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tdrd1Q99MV1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tdrd1Q99MV1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tdrd1Q99MV1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tdrd1Q99MV1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tdrd1Q99MV1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Tdrd1Q99MV1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tdrd1Q99MV1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tdrd1Q99MV1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tdrd1Q99MV1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tdrd1Q99MV1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tdrd1Q99MV1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tdrd1Q99MV1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tdrd1Q99MV1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tdrd1Q99MV1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tdrd1Q99MV1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tdrd1Q99MV1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tdrd1Q99MV1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tdrd1Q99MV1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tdrd1Q99MV1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tdrd1Q99MV1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tdrd1Q99MV1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tdrd1Q99MV1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tdrd1Q99MV1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tdrd1Q99MV1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tdrd1Q99MV1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tdrd1Q99MV1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tdrd1Q99MV1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tdrd1Q99MV1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tdrd1Q99MV1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tdrd1Q99MV1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tdrd1Q99MV1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tdrd1Q99MV1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tdrd1Q99MV1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tdrd1Q99MV1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tdrd1Q99MV1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tdrd1Q99MV1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tdrd1Q99MV1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tdrd1Q99MV1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tdrd1Q99MV1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tdrd1Q99MV1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tdrd1Q99MV1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tdrd1Q99MV1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Tdrd1Q99MV1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tdrd1Q99MV1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tdrd1Q99MV1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tdrd1Q99MV1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tdrd1Q99MV1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tdrd1Q99MV1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tdrd1Q99MV1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tdrd1Q99MV1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tdrd1Q99MV1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tdrd1Q99MV1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tdrd1Q99MV1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tdrd1Q99MV1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tdrd1Q99MV1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tdrd1Q99MV1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tdrd1Q99MV1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tdrd1Q99MV1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tdrd1Q99MV1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Tdrd1Q99MV1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tdrd1Q99MV1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tdrd1Q99MV1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tdrd1Q99MV1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tdrd1Q99MV1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tdrd1Q99MV1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tdrd1Q99MV1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tdrd1Q99MV1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tdrd1Q99MV1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tdrd1Q99MV1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tdrd1Q99MV1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tdrd1Q99MV1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tdrd1Q99MV1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tdrd1Q99MV1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms