Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS8

Tpgs1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs1Q99MS8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpgs1Q99MS8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpgs1Q99MS8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpgs1Q99MS8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpgs1Q99MS8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpgs1Q99MS8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpgs1Q99MS8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpgs1Q99MS8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpgs1Q99MS8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpgs1Q99MS8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpgs1Q99MS8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpgs1Q99MS8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpgs1Q99MS8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpgs1Q99MS8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpgs1Q99MS8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpgs1Q99MS8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpgs1Q99MS8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpgs1Q99MS8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpgs1Q99MS8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpgs1Q99MS8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpgs1Q99MS8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpgs1Q99MS8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpgs1Q99MS8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpgs1Q99MS8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpgs1Q99MS8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpgs1Q99MS8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpgs1Q99MS8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Tpgs1Q99MS8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpgs1Q99MS8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpgs1Q99MS8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpgs1Q99MS8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpgs1Q99MS8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tpgs1Q99MS8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpgs1Q99MS8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpgs1Q99MS8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Tpgs1Q99MS8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpgs1Q99MS8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpgs1Q99MS8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpgs1Q99MS8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpgs1Q99MS8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpgs1Q99MS8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpgs1Q99MS8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpgs1Q99MS8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpgs1Q99MS8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpgs1Q99MS8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpgs1Q99MS8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpgs1Q99MS8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpgs1Q99MS8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpgs1Q99MS8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpgs1Q99MS8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpgs1Q99MS8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpgs1Q99MS8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpgs1Q99MS8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpgs1Q99MS8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpgs1Q99MS8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tpgs1Q99MS8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpgs1Q99MS8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpgs1Q99MS8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpgs1Q99MS8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpgs1Q99MS8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpgs1Q99MS8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpgs1Q99MS8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpgs1Q99MS8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpgs1Q99MS8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpgs1Q99MS8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpgs1Q99MS8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpgs1Q99MS8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpgs1Q99MS8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpgs1Q99MS8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpgs1Q99MS8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpgs1Q99MS8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpgs1Q99MS8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpgs1Q99MS8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpgs1Q99MS8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpgs1Q99MS8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpgs1Q99MS8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpgs1Q99MS8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpgs1Q99MS8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpgs1Q99MS8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpgs1Q99MS8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpgs1Q99MS8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpgs1Q99MS8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpgs1Q99MS8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpgs1Q99MS8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpgs1Q99MS8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tpgs1Q99MS8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tpgs1Q99MS8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tpgs1Q99MS8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tpgs1Q99MS8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tpgs1Q99MS8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tpgs1Q99MS8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tpgs1Q99MS8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tpgs1Q99MS8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpgs1Q99MS8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpgs1Q99MS8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpgs1Q99MS8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpgs1Q99MS8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpgs1Q99MS8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpgs1Q99MS8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpgs1Q99MS8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms