Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Sh3bp5lQ99LH9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sh3bp5lQ99LH9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Sh3bp5lQ99LH9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sh3bp5lQ99LH9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Sh3bp5lQ99LH9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sh3bp5lQ99LH9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sh3bp5lQ99LH9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sh3bp5lQ99LH9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Sh3bp5lQ99LH9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sh3bp5lQ99LH9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sh3bp5lQ99LH9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sh3bp5lQ99LH9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sh3bp5lQ99LH9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sh3bp5lQ99LH9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sh3bp5lQ99LH9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sh3bp5lQ99LH9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sh3bp5lQ99LH9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sh3bp5lQ99LH9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sh3bp5lQ99LH9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sh3bp5lQ99LH9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sh3bp5lQ99LH9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sh3bp5lQ99LH9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sh3bp5lQ99LH9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sh3bp5lQ99LH9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sh3bp5lQ99LH9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sh3bp5lQ99LH9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sh3bp5lQ99LH9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sh3bp5lQ99LH9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sh3bp5lQ99LH9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sh3bp5lQ99LH9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sh3bp5lQ99LH9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sh3bp5lQ99LH9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sh3bp5lQ99LH9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sh3bp5lQ99LH9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sh3bp5lQ99LH9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sh3bp5lQ99LH9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sh3bp5lQ99LH9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sh3bp5lQ99LH9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sh3bp5lQ99LH9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sh3bp5lQ99LH9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Sh3bp5lQ99LH9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sh3bp5lQ99LH9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sh3bp5lQ99LH9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Sh3bp5lQ99LH9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sh3bp5lQ99LH9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sh3bp5lQ99LH9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sh3bp5lQ99LH9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sh3bp5lQ99LH9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sh3bp5lQ99LH9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sh3bp5lQ99LH9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sh3bp5lQ99LH9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sh3bp5lQ99LH9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sh3bp5lQ99LH9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sh3bp5lQ99LH9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sh3bp5lQ99LH9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sh3bp5lQ99LH9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sh3bp5lQ99LH9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sh3bp5lQ99LH9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sh3bp5lQ99LH9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sh3bp5lQ99LH9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sh3bp5lQ99LH9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sh3bp5lQ99LH9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sh3bp5lQ99LH9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sh3bp5lQ99LH9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sh3bp5lQ99LH9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sh3bp5lQ99LH9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sh3bp5lQ99LH9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sh3bp5lQ99LH9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sh3bp5lQ99LH9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sh3bp5lQ99LH9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sh3bp5lQ99LH9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sh3bp5lQ99LH9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sh3bp5lQ99LH9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sh3bp5lQ99LH9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sh3bp5lQ99LH9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sh3bp5lQ99LH9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sh3bp5lQ99LH9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Sh3bp5lQ99LH9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sh3bp5lQ99LH9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sh3bp5lQ99LH9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sh3bp5lQ99LH9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sh3bp5lQ99LH9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sh3bp5lQ99LH9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sh3bp5lQ99LH9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sh3bp5lQ99LH9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sh3bp5lQ99LH9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms